Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 LHP1YDL051W 828 nt5.91□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 RLM1YPL089C 2031 nt5.91□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 ALT1YLR089C 1779 nt5.9□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 RNR3YIL066C 2610 nt5.9□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 MEF1YLR069C 2286 nt5.9□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 PRO3YER023W 861 nt5.9□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 EMP24YGL200C 612 nt5.9□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 BUD28YLR062C 378 nt5.9□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 SFB3YHR098C 2790 nt5.9□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 NUD1YOR373W 2556 nt5.9□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 PHO8YDR481C 1701 nt5.89□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YNL010WYNL010W 726 nt5.89□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 NIC96YFR002W 2520 nt5.89□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 PRT1YOR361C 2292 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 CDC4YFL009W 2340 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 RKM1YPL208W 1752 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 ECM25YJL201W 1800 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 ULP1YPL020C 1866 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 IRC2YDR112W 309 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YPS5YGL259W 498 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 TDA8YAL064C-A 381 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 ISU2YOR226C 471 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 UBC4YBR082C 447 nt5.88□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 STE14YDR410C 720 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 UTR4YEL038W 684 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 RPS7BYNL096C 573 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 HOM3YER052C 1584 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 TOS3YGL179C 1683 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 DED81YHR019C 1665 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 HXT17YNR072W 1695 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 SSK1YLR006C 2139 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 UBA1YKL210W 3075 nt5.87□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 SEC18YBR080C 2277 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 TAX4YJL083W 1815 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YDL180WYDL180W 1644 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 STP1YDR463W 1560 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YDL012CYDL012C 324 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 IDP1YDL066W 1287 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 OLI1Q0130 231 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 TIM8YJR135W-A 264 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 LSM7YNL147W 348 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 SRB6YBR253W 366 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 SHG1YBR258C 429 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 TRM2YKR056W 1920 nt5.86□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 ALG11YNL048W 1647 nt5.85□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 KEX2YNL238W 2445 nt5.85□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 NUP1YOR098C 3231 nt5.85□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 FRQ1YDR373W 573 nt5.85□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 PAU2YEL049W 363 nt5.85□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YHL005CYHL005C 393 nt5.85□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YOL131WYOL131W 327 nt5.85□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 EMW1YNL313C 2715 nt5.85□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 PEX8YGR077C 1770 nt5.85□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 PPZ1YML016C 2079 nt5.84□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YDR262WYDR262W 819 nt5.84□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt5.84□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 GAT2YMR136W 1683 nt5.84□□□□□ -1.47
NCR1Q12200 YSW1YBR148W 1830 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 BRF1YGR246C 1791 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 ARG4YHR018C 1392 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 SNU13YEL026W 381 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 VPS69YPR087W 321 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 MCM6YGL201C 3054 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 PEX30YLR324W 1572 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 MSS1YMR023C 1581 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 LCB4YOR171C 1875 nt5.83□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 SOG2YOR353C 2376 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 GUP1YGL084C 1683 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 NDC1YML031W 1968 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 PPR1YLR014C 2715 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 IMD4YML056C 1575 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 RPL29YFR032C-A 180 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 TRP5YGL026C 2124 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YHR210CYHR210C 1026 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 TRM7YBR061C 933 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YPL238CYPL238C 390 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 MNT4YNR059W 1743 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 ROK1YGL171W 1695 nt5.82□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 ATP25YMR098C 1839 nt5.81□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YIR007WYIR007W 2295 nt5.81□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 CPR5YDR304C 678 nt5.81□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YPR195CYPR195C 330 nt5.81□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 GEX2YKR106W 1848 nt5.81□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 RAT1YOR048C 3021 nt5.8□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 ALD6YPL061W 1503 nt5.8□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 THI13YDL244W 1023 nt5.8□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 PSY1YKL076C 384 nt5.8□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 THI12YNL332W 1023 nt5.8□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 RET1YOR207C 3450 nt5.8□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YDL109CYDL109C 1944 nt5.8□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 RVB1YDR190C 1392 nt5.8□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 ARG2YJL071W 1725 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 SAC1YKL212W 1872 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 HSF1YGL073W 2502 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 NOT3YIL038C 2511 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 CEP3YMR168C 1827 nt5.79□□□□□ -1.48
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