Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCE1P61221 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms