Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB2P55268 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB2P55268 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms