Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms