Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC5P28715 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC5P28715 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC5P28715 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC5P28715 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC5P28715 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC5P28715 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC5P28715 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms