Protein–RNA interactions for Protein: C9J798

RASA4B, Ras GTPase-activating protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4BC9J798 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASA4BC9J798 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASA4BC9J798 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms