Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms