Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PNPLA3Q9NST1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNPLA3Q9NST1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms