Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCTN1Q2MV58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCTN1Q2MV58 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms