Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EEA1Q15075 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
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