Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SORDQ00796 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SORDQ00796 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SORDQ00796 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SORDQ00796 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SORDQ00796 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SORDQ00796 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SORDQ00796 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SORDQ00796 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SORDQ00796 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SORDQ00796 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SORDQ00796 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SORDQ00796 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SORDQ00796 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORDQ00796 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORDQ00796 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORDQ00796 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 662.4 ms