Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 RGC1YPR115W 3252 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 ERP3YDL018C 678 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 DBP10YDL031W 2988 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 GUK1YDR454C 564 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 VEL1YGL258W 621 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 RPL24BYGR148C 468 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 QCR10YHR001W-A 234 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 CUP1-1YHR053C 186 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 CUP1-2YHR055C 186 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 BAT1YHR208W 1182 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 PHD1YKL043W 1101 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 MCR1YKL150W 909 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 CDC123YLR215C 1083 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 ADI1YMR009W 540 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 MPD2YOL088C 834 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 PIG2YIL045W 1617 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 AEP1YMR064W 1557 nt3□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YPL216WYPL216W 3309 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YBP2YGL060W 1926 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 MAM1YER106W 909 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 MIG2YGL209W 1149 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YGR107WYGR107W 450 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 FAR3YMR052W 615 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YIL169CYIL169C 2988 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YJL049WYJL049W 1353 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 CBP2YHL038C 1893 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC28P40509 HOP1YIL072W 1818 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 AI2Q0055 2565 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 MRPL32YCR003W 552 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YGL082WYGL082W 1146 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 TCD1YHR003C 1290 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YIL141WYIL141W 390 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 SFH1YLR321C 1281 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 RPL6AYML073C 531 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 RPL19BYBL027W 570 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YOR366WYOR366W 354 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 CUP9YPL177C 921 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 MRS2YOR334W 1413 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 BOI1YBL085W 2943 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YKL222CYKL222C 2118 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC28P40509 MAK11YKL021C 1407 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 SEN54YPL083C 1404 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 RSM24YDR175C 960 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 SRB7YDR308C 423 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 RPN9YDR427W 1182 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YGL039WYGL039W 1047 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YIL054WYIL054W 318 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 ERV41YML067C 1059 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 BUD21YOR078W 645 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YPL142CYPL142C 318 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YNL193WYNL193W 1677 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC28P40509 HEH2YDR458C 1992 nt2.96□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YFL015CYFL015C 495 nt2.96□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YJL032WYJL032W 315 nt2.96□□□□□ -1.94
SEC28P40509 SRT1YMR101C 1032 nt2.96□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YBR116CYBR116C 528 nt2.96□□□□□ -1.94
SEC28P40509 APA1YCL050C 966 nt2.96□□□□□ -1.94
SEC28P40509 VPS30YPL120W 1674 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YOL057WYOL057W 2136 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 TCB2YNL087W 3537 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 BPT1YLL015W 4680 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 PPX1YHR201C 1194 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 SEC14YMR079W 915 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 VPS33YLR396C 2076 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 PMR1YGL167C 2853 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 ECM21YBL101C 3354 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 DYN1YKR054C 12279 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 RAX2YLR084C 3663 nt2.95□□□□□ -1.94
SEC28P40509 MET6YER091C 2304 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 ESA1YOR244W 1338 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 TFB1YDR311W 1929 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 PPH3YDR075W 927 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 RUB1YDR139C 234 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YFR054CYFR054C 579 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 GPN3YLR243W 819 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 MRPL16YBL038W 699 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YOL162WYOL162W 648 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 KAR4YCL055W 1008 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 MSB2YGR014W 3921 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.94□□□□□ -1.94
SEC28P40509 TLC1TLC1 1301 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 RSR1YGR152C 819 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YHL044WYHL044W 708 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 SVP26YHR181W 687 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 SFT1YKL006C-A 294 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 RPF2YKR081C 1035 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 ARC18YLR370C 537 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YNL089CYNL089C 477 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YOR277CYOR277C 309 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 RRG7YOR305W 729 nt2.93□□□□□ -1.94
SEC28P40509 PEX34YCL056C 435 nt2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.5 ms