Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YCL007CYCL007C 393 nt3.11□□□□□ -1.91
NDI1P32340 MSH2YOL090W 2895 nt3.11□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.11□□□□□ -1.91
NDI1P32340 REG1YDR028C 3045 nt3.11□□□□□ -1.91
NDI1P32340 MYO5YMR109W 3660 nt3.11□□□□□ -1.91
NDI1P32340 DOA4YDR069C 2781 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 PSP1YDR505C 2526 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 HMO1YDR174W 741 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YDR248CYDR248C 582 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YIP5YGL161C 933 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 TAD1YGL243W 1203 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 LIN1YHR156C 1023 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YLR400WYLR400W 474 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 PFY1YOR122C 381 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YMR046CYMR046C 1323 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 EMP70YLR083C 2004 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 AGE1YDR524C 1449 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 CHS2YBR038W 2892 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 RGC1YPR115W 3252 nt3.1□□□□□ -1.91
NDI1P32340 NOP56YLR197W 1515 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 ENA5YDR038C 3276 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 ENA2YDR039C 3276 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 ENA1YDR040C 3276 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 RIM1YCR028C-A 408 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YDL050CYDL050C 372 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 COBQ0105 1158 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 RPS28BYLR264W 204 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 NNT1YLR285W 786 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YNL013CYNL013C 378 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 YCL002CYCL002C 792 nt3.09□□□□□ -1.91
NDI1P32340 SPP382YLR424W 2127 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 SRP1YNL189W 1629 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 RPN1YHR027C 2982 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 SMX2YFL017W-A 234 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 UPF3YGR072W 1164 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YGR226CYGR226C 210 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YJR020WYJR020W 333 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 ILV5YLR355C 1188 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 FAR3YMR052W 615 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 MRPL16YBL038W 699 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YMR141CYMR141C 309 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YAP7YOL028C 738 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YBP2YGL060W 1926 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 RCY1YJL204C 2523 nt3.08□□□□□ -1.92
NDI1P32340 CDH1YGL003C 1701 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 BEM4YPL161C 1902 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 STE23YLR389C 3084 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 IRC3YDR332W 2070 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 VPS33YLR396C 2076 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 ARP5YNL059C 2268 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 RED1YLR263W 2484 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 VAB2YEL005C 849 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 RSM18YER050C 417 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YGR160WYGR160W 612 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 GOS1YHL031C 672 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 VMA6YLR447C 1038 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 MCA1YOR197W 1299 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YOR387CYOR387C 621 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YDL180WYDL180W 1644 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 TPO5YKL174C 1857 nt3.07□□□□□ -1.92
NDI1P32340 FUN30YAL019W 3396 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 CSR2YPR030W 3366 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 TRM82YDR165W 1335 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YCG1YDR325W 3108 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 VPS3YDR495C 3036 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 LOC1YFR001W 615 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 PRP38YGR075C 729 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YJL114WYJL114W 681 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YNL109WYNL109W 546 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 ATP11YNL315C 957 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 APC5YOR249C 2058 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 LOA1YPR139C 903 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 RRP15YPR143W 753 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YPR147CYPR147C 915 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 TFC1YBR123C 1950 nt3.06□□□□□ -1.92
NDI1P32340 GIS4YML006C 2325 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 UBP8YMR223W 1416 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 KRE2YDR483W 1329 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 NSE4YDL105W 1209 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YDR193WYDR193W 399 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YFL015CYFL015C 495 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 YKL115CYKL115C 393 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 ATG10YLL042C 504 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 ATG38YLR211C 681 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 JJJ1YNL227C 1773 nt3.05□□□□□ -1.92
NDI1P32340 MET5YJR137C 4329 nt3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms