Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00271P0C7V0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00271P0C7V0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00271P0C7V0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00271P0C7V0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00271P0C7V0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00271P0C7V0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00271P0C7V0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00271P0C7V0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms