Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3KRW8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3KRW8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3KRW8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3KRW8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3KRW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KRW8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KRW8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KRW8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KRW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KRW8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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