Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP69A5D8W1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms