Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 GND1YHR183W 1470 nt9.52□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 PRY1YJL079C 900 nt9.51□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 BNI5YNL166C 1347 nt9.51□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 FLR1YBR008C 1647 nt9.5□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 APT2YDR441C 546 nt9.5□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 SPP2YOR148C 558 nt9.5□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 FMS1YMR020W 1527 nt9.5□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 YOR325WYOR325W 474 nt9.49□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 RSC8YFR037C 1674 nt9.48□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 SEC61YLR378C 1443 nt9.48□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.47□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 DLD2YDL178W 1593 nt9.46□□□□□ -0.89
AVL9Q12500 YNL024CYNL024C 741 nt9.46□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 CSM1YCR086W 573 nt9.45□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 HEL2YDR266C 1920 nt9.44□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 YPS3YLR121C 1527 nt9.44□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 MUP1YGR055W 1725 nt9.43□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 YJL055WYJL055W 738 nt9.42□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 NUC1YJL208C 990 nt9.42□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 MSC1YML128C 1542 nt9.41□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 FUB1YCR076C 753 nt9.41□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 OXA1YER154W 1209 nt9.41□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 YER188WYER188W 720 nt9.41□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 PHO23YNL097C 993 nt9.41□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 ACH1YBL015W 1581 nt9.41□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 GID7YCL039W 2238 nt9.4□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 ILV3YJR016C 1758 nt9.4□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.4□□□□□ -0.9
AVL9Q12500 VRG4YGL225W 1014 nt9.39□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 RAS2YNL098C 969 nt9.39□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 LSB5YCL034W 1065 nt9.39□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 VPS62YGR141W 1404 nt9.39□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 CCT2YIL142W 1584 nt9.38□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 HEM13YDR044W 987 nt9.37□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 RIB2YOL066C 1776 nt9.37□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 OSH7YHR001W 1314 nt9.35□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 YPI1YFR003C 468 nt9.35□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 BET2YPR176C 978 nt9.34□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 HOL1YNR055C 1761 nt9.34□□□□□ -0.91
AVL9Q12500 RPT5YOR117W 1305 nt9.33□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 SAM3YPL274W 1764 nt9.33□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 OPI10YOL032W 741 nt9.32□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 YDL086WYDL086W 822 nt9.31□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 YJL118WYJL118W 660 nt9.31□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 YNR029CYNR029C 1290 nt9.31□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 ESBP6YNL125C 2022 nt9.31□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 HXT12YIL170W 1374 nt9.3□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 SOL2YCR073W-A 948 nt9.3□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 TPS1YBR126C 1488 nt9.29□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 ADH1YOL086C 1047 nt9.29□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 ARO8YGL202W 1503 nt9.29□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 TAT2YOL020W 1779 nt9.29□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 OYE2YHR179W 1203 nt9.28□□□□□ -0.92
AVL9Q12500 LSB6YJL100W 1824 nt9.27□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 LSM5YER146W 282 nt9.27□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 EAF3YPR023C 1206 nt9.27□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 COQ8YGL119W 1506 nt9.26□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 RIM8YGL045W 1629 nt9.25□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 QDR2YIL121W 1629 nt9.24□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 GAL3YDR009W 1563 nt9.23□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 KES1YPL145C 1305 nt9.23□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 YDR455CYDR455C 309 nt9.22□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 DDI1YER143W 1287 nt9.22□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 AIM1YAL046C 357 nt9.22□□□□□ -0.93
AVL9Q12500 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.21□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.21□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.21□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.21□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 GPN2YOR262W 1044 nt9.21□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 RIB7YBR153W 735 nt9.21□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 YGL114WYGL114W 2178 nt9.2□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 YJL195CYJL195C 702 nt9.2□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 DIG1YPL049C 1359 nt9.19□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 NPP1YCR026C 2229 nt9.19□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 SGA1YIL099W 1650 nt9.17□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 GID8YMR135C 1368 nt9.16□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 RFC1YOR217W 2586 nt9.15□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 HIS2YFR025C 1008 nt9.15□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 TMA23YMR269W 636 nt9.15□□□□□ -0.94
AVL9Q12500 MET2YNL277W 1461 nt9.15□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 UGP1YKL035W 1500 nt9.14□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 MAE1YKL029C 2010 nt9.14□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 ERG13YML126C 1476 nt9.13□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 YLR046CYLR046C 813 nt9.12□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 DTR1YBR180W 1719 nt9.11□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 FUN14YAL008W 597 nt9.1□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 SNZ1YMR096W 894 nt9.1□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 MRS6YOR370C 1812 nt9.1□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 YKL133CYKL133C 1392 nt9.09□□□□□ -0.95
AVL9Q12500 SFP1YLR403W 2052 nt9.08□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 IMO32YGR031W 1029 nt9.08□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 ENT4YLL038C 744 nt9.07□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 YHR219WYHR219W 1875 nt9.05□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 CCT5YJR064W 1689 nt9.05□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 YMR209CYMR209C 1374 nt9.05□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 ZAP1YJL056C 2643 nt9.04□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 DAK2YFL053W 1776 nt9.04□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 YEL008WYEL008W 381 nt9.04□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 LSR1LSR1 1175 nt9.04□□□□□ -0.96
AVL9Q12500 ITR2YOL103W 1830 nt9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.7 ms