Protein–RNA interactions for Protein: Q12365

BBP1, Spindle pole component BBP1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BBP1Q12365 ACH1YBL015W 1581 nt8.39□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 YDR010CYDR010C 333 nt8.38□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 MIM1YOL026C 342 nt8.38□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 YBL086CYBL086C 1401 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 POM34YLR018C 900 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 SHH4YLR164W 507 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 TOM71YHR117W 1920 nt8.37□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 RET2YFR051C 1641 nt8.36□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 DIG1YPL049C 1359 nt8.36□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 UFO1YML088W 2007 nt8.36□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 YSR3YKR053C 1215 nt8.36□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 CWP2YKL096W-A 279 nt8.35□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 YCR087WYCR087W 516 nt8.34□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 PRO1YDR300C 1287 nt8.34□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 YHR219WYHR219W 1875 nt8.34□□□□□ -1.07
BBP1Q12365 YRF1-2YER190W 5046 nt8.34□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 DIF1YLR437C 402 nt8.33□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 PHO89YBR296C 1725 nt8.33□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 HBS1YKR084C 1836 nt8.32□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 ATG15YCR068W 1563 nt8.31□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 SFL1YOR140W 2301 nt8.3□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 LSR1LSR1 1175 nt8.3□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 YGL034CYGL034C 366 nt8.29□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 PET8YNL003C 855 nt8.29□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 SPP2YOR148C 558 nt8.29□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 FMS1YMR020W 1527 nt8.29□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.28□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 OYE3YPL171C 1203 nt8.28□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 DUS3YLR401C 2007 nt8.28□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 DUR3YHL016C 2208 nt8.27□□□□□ -1.08
BBP1Q12365 LIP1YMR298W 453 nt8.27□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 FET5YFL041W 1869 nt8.26□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 SFA1YDL168W 1161 nt8.26□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 YDL086WYDL086W 822 nt8.25□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 VPS62YGR141W 1404 nt8.25□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 XYL2YLR070C 1071 nt8.24□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 TIM44YIL022W 1296 nt8.23□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 TOM6YOR045W 186 nt8.23□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 AIM45YPR004C 1035 nt8.23□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 MET30YIL046W 1923 nt8.23□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 YNL190WYNL190W 615 nt8.22□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 LEU9YOR108W 1815 nt8.22□□□□□ -1.09
BBP1Q12365 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 COQ2YNR041C 1119 nt8.21□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 LSM5YER146W 282 nt8.2□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 CLB6YGR109C 1143 nt8.2□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 YMR262WYMR262W 942 nt8.2□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 TIF6YPR016C 738 nt8.2□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 FRA1YLL029W 2250 nt8.2□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 RPD3YNL330C 1302 nt8.2□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 POP2YNR052C 1302 nt8.2□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 RPL4BYDR012W 1089 nt8.18□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 MET28YIR017C 564 nt8.18□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 RPL4AYBR031W 1089 nt8.18□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 HIP1YGR191W 1812 nt8.17□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 LAS17YOR181W 1902 nt8.17□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 SAM1YLR180W 1149 nt8.17□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 YPS3YLR121C 1527 nt8.17□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 SED1YDR077W 1017 nt8.16□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 YAR028WYAR028W 705 nt8.16□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 FLR1YBR008C 1647 nt8.15□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 PEX2YJL210W 816 nt8.15□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 UTH1YKR042W 1098 nt8.15□□□□□ -1.1
BBP1Q12365 HEM14YER014W 1620 nt8.14□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 TOA2YKL058W 369 nt8.14□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 GND2YGR256W 1479 nt8.13□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 SAM2YDR502C 1155 nt8.13□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 BRR1YPR057W 1026 nt8.13□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 RIM2YBR192W 1134 nt8.13□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 DLD3YEL071W 1491 nt8.13□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 INH1YDL181W 258 nt8.12□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 ORT1YOR130C 879 nt8.12□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 FIT3YOR383C 615 nt8.12□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 snR4snR4 186 nt8.12□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 ADE16YLR028C 1776 nt8.11□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.1□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 YPL251WYPL251W 303 nt8.1□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 DPL1YDR294C 1770 nt8.09□□□□□ -1.11
BBP1Q12365 RPS14BYJL191W 417 nt8.08□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 RPC31YNL151C 756 nt8.08□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 ALP1YNL270C 1722 nt8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.6 ms