Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 CAB5YDR196C 726 nt9□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 POM34YLR018C 900 nt9□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 YML089CYML089C 369 nt9□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 YLR279WYLR279W 390 nt8.99□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 MET28YIR017C 564 nt8.98□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 YJL067WYJL067W 351 nt8.98□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.98□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 ILV3YJR016C 1758 nt8.98□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 PRO1YDR300C 1287 nt8.97□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 ATG15YCR068W 1563 nt8.96□□□□□ -0.97
HSP42Q12329 SFL1YOR140W 2301 nt8.96□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 GCD11YER025W 1584 nt8.95□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 HIS2YFR025C 1008 nt8.95□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 GPN2YOR262W 1044 nt8.95□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 LSC2YGR244C 1284 nt8.94□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 ADH1YOL086C 1047 nt8.93□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 MTO1YGL236C 2010 nt8.92□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 UTR1YJR049C 1593 nt8.92□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 TIF6YPR016C 738 nt8.92□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 YOR325WYOR325W 474 nt8.91□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 UGP1YKL035W 1500 nt8.9□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 YPI1YFR003C 468 nt8.9□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 SAM35YHR083W 990 nt8.9□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 FIT3YOR383C 615 nt8.9□□□□□ -0.98
HSP42Q12329 COQ8YGL119W 1506 nt8.9□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 MSB4YOL112W 1479 nt8.89□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 YHL008CYHL008C 1884 nt8.87□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 MAM3YOL060C 2121 nt8.87□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.87□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 HXK1YFR053C 1458 nt8.87□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 YEL008WYEL008W 381 nt8.86□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 CPD1YGR247W 720 nt8.86□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 LOT5YKL183W 921 nt8.86□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 DUR3YHL016C 2208 nt8.86□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.85□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 PSD1YNL169C 1503 nt8.84□□□□□ -0.99
HSP42Q12329 GND1YHR183W 1470 nt8.83□□□□□ -1
HSP42Q12329 YEL023CYEL023C 2049 nt8.81□□□□□ -1
HSP42Q12329 ARO8YGL202W 1503 nt8.8□□□□□ -1
HSP42Q12329 OPI10YOL032W 741 nt8.8□□□□□ -1
HSP42Q12329 ALR1YOL130W 2580 nt8.8□□□□□ -1
HSP42Q12329 APT2YDR441C 546 nt8.79□□□□□ -1
HSP42Q12329 ESS1YJR017C 513 nt8.79□□□□□ -1
HSP42Q12329 CYT1YOR065W 930 nt8.78□□□□□ -1
HSP42Q12329 HXT10YFL011W 1641 nt8.78□□□□□ -1
HSP42Q12329 KES1YPL145C 1305 nt8.77□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 SGA1YIL099W 1650 nt8.76□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 ALD5YER073W 1563 nt8.76□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 SSL2YIL143C 2532 nt8.75□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 HXT1YHR094C 1713 nt8.74□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 ALP1YNL270C 1722 nt8.74□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 SMM1YNR015W 1155 nt8.74□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 DBP1YPL119C 1854 nt8.74□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 YJL045WYJL045W 1905 nt8.74□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 CCT2YIL142W 1584 nt8.73□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 DMA2YNL116W 1569 nt8.73□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 SHY1YGR112W 1170 nt8.72□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 BET2YPR176C 978 nt8.72□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 ECM10YEL030W 1935 nt8.72□□□□□ -1.01
HSP42Q12329 YAR028WYAR028W 705 nt8.71□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 AKR2YOR034C 2250 nt8.71□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.71□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 RSC8YFR037C 1674 nt8.7□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 CWC15YDR163W 528 nt8.7□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 NAP1YKR048C 1254 nt8.69□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 SEN2YLR105C 1134 nt8.69□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 RIB2YOL066C 1776 nt8.68□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 STF1YDL130W-A 261 nt8.68□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 ZTA1YBR046C 1005 nt8.68□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 ZAP1YJL056C 2643 nt8.67□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 LSB6YJL100W 1824 nt8.66□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 DIF1YLR437C 402 nt8.66□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 Q0010Q0010 387 nt8.65□□□□□ -1.02
HSP42Q12329 MDL2YPL270W 2322 nt8.65□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 MTG2YHR168W 1557 nt8.65□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 YHR218WYHR218W 1812 nt8.63□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 VRG4YGL225W 1014 nt8.62□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 MEP3YPR138C 1470 nt8.62□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 PAU5YFL020C 369 nt8.61□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.61□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 FCY21YER060W 1587 nt8.61□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 URA6YKL024C 615 nt8.6□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 PUP1YOR157C 786 nt8.6□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 ODC1YPL134C 933 nt8.59□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 VPS62YGR141W 1404 nt8.59□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 GUT1YHL032C 2130 nt8.59□□□□□ -1.03
HSP42Q12329 YBL086CYBL086C 1401 nt8.57□□□□□ -1.04
HSP42Q12329 PRY1YJL079C 900 nt8.57□□□□□ -1.04
HSP42Q12329 QDR2YIL121W 1629 nt8.54□□□□□ -1.04
HSP42Q12329 HXT12YIL170W 1374 nt8.54□□□□□ -1.04
HSP42Q12329 PCP1YGR101W 1041 nt8.54□□□□□ -1.04
HSP42Q12329 YOR072WYOR072W 315 nt8.54□□□□□ -1.04
HSP42Q12329 PGC1YPL206C 966 nt8.54□□□□□ -1.04
HSP42Q12329 YJL055WYJL055W 738 nt8.53□□□□□ -1.04
HSP42Q12329 STP3YLR375W 1032 nt8.53□□□□□ -1.04
HSP42Q12329 SED1YDR077W 1017 nt8.52□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 197.7 ms