Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 SSN3YPL042C 1668 nt9□□□□□ -0.97
RRP42Q12277 SEC61YLR378C 1443 nt8.97□□□□□ -0.97
RRP42Q12277 NUC1YJL208C 990 nt8.97□□□□□ -0.97
RRP42Q12277 CWC15YDR163W 528 nt8.96□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 BNI5YNL166C 1347 nt8.95□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 VRG4YGL225W 1014 nt8.94□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 LSB5YCL034W 1065 nt8.94□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 CSM1YCR086W 573 nt8.93□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 OXA1YER154W 1209 nt8.93□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 PHO23YNL097C 993 nt8.93□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 ADH1YOL086C 1047 nt8.93□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 HXT12YIL170W 1374 nt8.91□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 YNR029CYNR029C 1290 nt8.91□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 RIB2YOL066C 1776 nt8.91□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 YJL055WYJL055W 738 nt8.9□□□□□ -0.98
RRP42Q12277 MSC1YML128C 1542 nt8.9□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 RSC8YFR037C 1674 nt8.89□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 YER188WYER188W 720 nt8.89□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 YJL195CYJL195C 702 nt8.89□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 RPC82YPR190C 1965 nt8.88□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 SPP2YOR148C 558 nt8.87□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 DLD2YDL178W 1593 nt8.86□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 RPT5YOR117W 1305 nt8.86□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 FLR1YBR008C 1647 nt8.86□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 SFP1YLR403W 2052 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 FMS1YMR020W 1527 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 SPT20YOL148C 1815 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 MET2YNL277W 1461 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 YJL118WYJL118W 660 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 RAS2YNL098C 969 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 YPS3YLR121C 1527 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 FUB1YCR076C 753 nt8.84□□□□□ -0.99
RRP42Q12277 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.83□□□□□ -1
RRP42Q12277 FUN14YAL008W 597 nt8.83□□□□□ -1
RRP42Q12277 RIB7YBR153W 735 nt8.82□□□□□ -1
RRP42Q12277 OSH7YHR001W 1314 nt8.81□□□□□ -1
RRP42Q12277 VPS62YGR141W 1404 nt8.81□□□□□ -1
RRP42Q12277 FRE6YLL051C 2139 nt8.8□□□□□ -1
RRP42Q12277 SAM3YPL274W 1764 nt8.8□□□□□ -1
RRP42Q12277 NPP1YCR026C 2229 nt8.79□□□□□ -1
RRP42Q12277 OYE2YHR179W 1203 nt8.79□□□□□ -1
RRP42Q12277 YEL008WYEL008W 381 nt8.76□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 STE4YOR212W 1272 nt8.76□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 GAL3YDR009W 1563 nt8.76□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 ACH1YBL015W 1581 nt8.76□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 TPS1YBR126C 1488 nt8.76□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 YDL086WYDL086W 822 nt8.75□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 ILV3YJR016C 1758 nt8.75□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 HEM13YDR044W 987 nt8.74□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 EAF3YPR023C 1206 nt8.74□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 GID7YCL039W 2238 nt8.73□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 SOL2YCR073W-A 948 nt8.73□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 YOR325WYOR325W 474 nt8.73□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 CCT2YIL142W 1584 nt8.73□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 YNL024CYNL024C 741 nt8.72□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 OPI10YOL032W 741 nt8.72□□□□□ -1.01
RRP42Q12277 MUP1YGR055W 1725 nt8.69□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 LSM5YER146W 282 nt8.69□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 YLR349WYLR349W 507 nt8.69□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 CCT5YJR064W 1689 nt8.69□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 GPN2YOR262W 1044 nt8.68□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.67□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.67□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.67□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.67□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 HMG2YLR450W 3138 nt8.67□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 DDI1YER143W 1287 nt8.66□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 TMA23YMR269W 636 nt8.65□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 TAT2YOL020W 1779 nt8.65□□□□□ -1.02
RRP42Q12277 THI72YOR192C 1800 nt8.64□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 ADH7YCR105W 1086 nt8.64□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 MAE1YKL029C 2010 nt8.64□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 CPD1YGR247W 720 nt8.63□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 RAD51YER095W 1203 nt8.62□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 AIM1YAL046C 357 nt8.62□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 DIG1YPL049C 1359 nt8.61□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 BET2YPR176C 978 nt8.61□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 DAK2YFL053W 1776 nt8.61□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 YDR455CYDR455C 309 nt8.6□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 SNZ1YMR096W 894 nt8.6□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 TPO4YOR273C 1980 nt8.59□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 IMO32YGR031W 1029 nt8.59□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 PAU15YIR041W 375 nt8.59□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 TAF13YML098W 504 nt8.59□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 YPR126CYPR126C 309 nt8.59□□□□□ -1.03
RRP42Q12277 QDR2YIL121W 1629 nt8.58□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 LSB6YJL100W 1824 nt8.58□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 ERG13YML126C 1476 nt8.57□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 ENT4YLL038C 744 nt8.57□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 ARO8YGL202W 1503 nt8.57□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 HOL1YNR055C 1761 nt8.57□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 COQ8YGL119W 1506 nt8.56□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 IML3YBR107C 738 nt8.56□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 KES1YPL145C 1305 nt8.55□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 RIM8YGL045W 1629 nt8.55□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 ADE8YDR408C 645 nt8.55□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 YLR046CYLR046C 813 nt8.55□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 RRT8YOL048C 1029 nt8.55□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 CTI6YPL181W 1521 nt8.54□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 MHF1YOL086W-A 273 nt8.53□□□□□ -1.04
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