Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 UBA4YHR111W 1323 nt8.7□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 QDR2YIL121W 1629 nt8.69□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 SSL2YIL143C 2532 nt8.69□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 MDM35YKL053C-A 261 nt8.69□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 SAM1YLR180W 1149 nt8.69□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YAR028WYAR028W 705 nt8.68□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 NRT1YOR071C 1797 nt8.68□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.67□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 Q0010Q0010 387 nt8.67□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 ACH1YBL015W 1581 nt8.66□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 NBA1YOL070C 1506 nt8.66□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YGL034CYGL034C 366 nt8.66□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 VPS62YGR141W 1404 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 DIG1YPL049C 1359 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YCR087WYCR087W 516 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YDL086WYDL086W 822 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YSR3YKR053C 1215 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YMR244WYMR244W 1068 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 TOM6YOR045W 186 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 ZTA1YBR046C 1005 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.65□□□□□ -1.02
CIK1Q01649 GID8YMR135C 1368 nt8.64□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 SFA1YDL168W 1161 nt8.64□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 RBG1YAL036C 1110 nt8.64□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 TOK1YJL093C 2076 nt8.63□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 SPP2YOR148C 558 nt8.63□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 PHO89YBR296C 1725 nt8.63□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 TOA2YKL058W 369 nt8.62□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 PHO23YNL097C 993 nt8.62□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 TIF6YPR016C 738 nt8.62□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 FMS1YMR020W 1527 nt8.61□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 BRR1YPR057W 1026 nt8.61□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 UFD1YGR048W 1086 nt8.6□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.6□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 MRS6YOR370C 1812 nt8.59□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 DAK2YFL053W 1776 nt8.59□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 MTG2YHR168W 1557 nt8.59□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 YKL133CYKL133C 1392 nt8.59□□□□□ -1.03
CIK1Q01649 XYL2YLR070C 1071 nt8.58□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 GLR1YPL091W 1452 nt8.57□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 PEX2YJL210W 816 nt8.57□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 CWP2YKL096W-A 279 nt8.57□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 YPL251WYPL251W 303 nt8.57□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 PUS7YOR243C 2031 nt8.56□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 LSB5YCL034W 1065 nt8.56□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 GND2YGR256W 1479 nt8.56□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 AGP3YFL055W 1677 nt8.56□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 YPS3YLR121C 1527 nt8.55□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 LSR1LSR1 1175 nt8.55□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 MIM1YOL026C 342 nt8.55□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 LPD1YFL018C 1500 nt8.54□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 FIT1YDR534C 1587 nt8.53□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 HIP1YGR191W 1812 nt8.53□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 AIM45YPR004C 1035 nt8.53□□□□□ -1.04
CIK1Q01649 TPN1YGL186C 1740 nt8.52□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 MET28YIR017C 564 nt8.52□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 COQ2YNR041C 1119 nt8.52□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 SAM2YDR502C 1155 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 GNP1YDR508C 1992 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 ALP1YNL270C 1722 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 FLR1YBR008C 1647 nt8.51□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 YJR154WYJR154W 1041 nt8.5□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 YHR219WYHR219W 1875 nt8.49□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 RPL4BYDR012W 1089 nt8.49□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 CLB6YGR109C 1143 nt8.49□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 RPL4AYBR031W 1089 nt8.49□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 AKR2YOR034C 2250 nt8.49□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 OXA1YER154W 1209 nt8.47□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 RBG2YGR173W 1107 nt8.47□□□□□ -1.05
CIK1Q01649 HBS1YKR084C 1836 nt8.46□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 TIM44YIL022W 1296 nt8.46□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 UTH1YKR042W 1098 nt8.46□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 DLD2YDL178W 1593 nt8.46□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 SEC61YLR378C 1443 nt8.46□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 YMR103CYMR103C 363 nt8.44□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 TOM71YHR117W 1920 nt8.43□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 FIT3YOR383C 615 nt8.43□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 RPD3YNL330C 1302 nt8.43□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 YMR262WYMR262W 942 nt8.42□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 RPS14BYJL191W 417 nt8.4□□□□□ -1.06
CIK1Q01649 YMR226CYMR226C 804 nt8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.7 ms