Protein–RNA interactions for Protein: P43124

NSE4, Non-structural maintenance of chromosome element 4, yeastyeast

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4P43124 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 YML089CYML089C 369 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 MIM1YOL026C 342 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 ALR1YOL130W 2580 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 YSP3YOR003W 1437 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 LPD1YFL018C 1500 nt7.66□□□□□ -1.18
NSE4P43124 YPS3YLR121C 1527 nt7.65□□□□□ -1.18
NSE4P43124 SAM1YLR180W 1149 nt7.65□□□□□ -1.18
NSE4P43124 LSR1LSR1 1175 nt7.65□□□□□ -1.18
NSE4P43124 HBS1YKR084C 1836 nt7.64□□□□□ -1.19
NSE4P43124 RBG1YAL036C 1110 nt7.64□□□□□ -1.19
NSE4P43124 FLR1YBR008C 1647 nt7.63□□□□□ -1.19
NSE4P43124 SPP1YPL138C 1062 nt7.63□□□□□ -1.19
NSE4P43124 YPL251WYPL251W 303 nt7.63□□□□□ -1.19
NSE4P43124 FET5YFL041W 1869 nt7.63□□□□□ -1.19
NSE4P43124 HEM14YER014W 1620 nt7.63□□□□□ -1.19
NSE4P43124 TOA2YKL058W 369 nt7.62□□□□□ -1.19
NSE4P43124 BRR1YPR057W 1026 nt7.62□□□□□ -1.19
NSE4P43124 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.61□□□□□ -1.19
NSE4P43124 YMR262WYMR262W 942 nt7.61□□□□□ -1.19
NSE4P43124 LSB5YCL034W 1065 nt7.61□□□□□ -1.19
NSE4P43124 GND2YGR256W 1479 nt7.61□□□□□ -1.19
NSE4P43124 DUR3YHL016C 2208 nt7.6□□□□□ -1.19
NSE4P43124 TIM44YIL022W 1296 nt7.6□□□□□ -1.19
NSE4P43124 TPN1YGL186C 1740 nt7.59□□□□□ -1.19
NSE4P43124 YAR028WYAR028W 705 nt7.59□□□□□ -1.19
NSE4P43124 RPD3YNL330C 1302 nt7.57□□□□□ -1.2
NSE4P43124 DUS3YLR401C 2007 nt7.57□□□□□ -1.2
NSE4P43124 DLD3YEL071W 1491 nt7.56□□□□□ -1.2
NSE4P43124 MTG2YHR168W 1557 nt7.55□□□□□ -1.2
NSE4P43124 TOM6YOR045W 186 nt7.55□□□□□ -1.2
NSE4P43124 RIM2YBR192W 1134 nt7.55□□□□□ -1.2
NSE4P43124 TIF6YPR016C 738 nt7.54□□□□□ -1.2
NSE4P43124 HEM13YDR044W 987 nt7.53□□□□□ -1.2
NSE4P43124 DLD2YDL178W 1593 nt7.53□□□□□ -1.2
NSE4P43124 TOM71YHR117W 1920 nt7.52□□□□□ -1.2
NSE4P43124 DPL1YDR294C 1770 nt7.52□□□□□ -1.21
NSE4P43124 LSM5YER146W 282 nt7.52□□□□□ -1.21
NSE4P43124 MOT3YMR070W 1473 nt7.51□□□□□ -1.21
NSE4P43124 HIP1YGR191W 1812 nt7.51□□□□□ -1.21
NSE4P43124 POP2YNR052C 1302 nt7.51□□□□□ -1.21
NSE4P43124 SFA1YDL168W 1161 nt7.5□□□□□ -1.21
NSE4P43124 RPC31YNL151C 756 nt7.5□□□□□ -1.21
NSE4P43124 SFL1YOR140W 2301 nt7.5□□□□□ -1.21
NSE4P43124 INH1YDL181W 258 nt7.49□□□□□ -1.21
NSE4P43124 UTH1YKR042W 1098 nt7.49□□□□□ -1.21
NSE4P43124 LEU4YNL104C 1860 nt7.48□□□□□ -1.21
NSE4P43124 SAM2YDR502C 1155 nt7.47□□□□□ -1.21
NSE4P43124 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.47□□□□□ -1.21
NSE4P43124 YMR103CYMR103C 363 nt7.47□□□□□ -1.21
NSE4P43124 YNL190WYNL190W 615 nt7.47□□□□□ -1.21
NSE4P43124 PRE6YOL038W 765 nt7.47□□□□□ -1.21
NSE4P43124 YNL115CYNL115C 1935 nt7.46□□□□□ -1.21
NSE4P43124 OXA1YER154W 1209 nt7.46□□□□□ -1.22
NSE4P43124 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.46□□□□□ -1.22
NSE4P43124 AIM1YAL046C 357 nt7.46□□□□□ -1.22
NSE4P43124 NSG2YNL156C 900 nt7.46□□□□□ -1.22
NSE4P43124 ORT1YOR130C 879 nt7.46□□□□□ -1.22
NSE4P43124 MET30YIL046W 1923 nt7.46□□□□□ -1.22
NSE4P43124 NPP2YEL016C 1482 nt7.45□□□□□ -1.22
NSE4P43124 YLR046CYLR046C 813 nt7.45□□□□□ -1.22
NSE4P43124 FRA1YLL029W 2250 nt7.45□□□□□ -1.22
NSE4P43124 LAS17YOR181W 1902 nt7.44□□□□□ -1.22
NSE4P43124 ITR2YOL103W 1830 nt7.44□□□□□ -1.22
NSE4P43124 MSF1YPR047W 1410 nt7.44□□□□□ -1.22
NSE4P43124 KRR1YCL059C 951 nt7.43□□□□□ -1.22
NSE4P43124 VMA11YPL234C 495 nt7.43□□□□□ -1.22
NSE4P43124 snR4snR4 186 nt7.43□□□□□ -1.22
NSE4P43124 HXT11YOL156W 1704 nt7.43□□□□□ -1.22
NSE4P43124 ADE16YLR028C 1776 nt7.43□□□□□ -1.22
NSE4P43124 SEC61YLR378C 1443 nt7.43□□□□□ -1.22
NSE4P43124 AKR2YOR034C 2250 nt7.43□□□□□ -1.22
NSE4P43124 PEX2YJL210W 816 nt7.42□□□□□ -1.22
NSE4P43124 VPS75YNL246W 795 nt7.42□□□□□ -1.22
NSE4P43124 ENT4YLL038C 744 nt7.4□□□□□ -1.22
NSE4P43124 TRP2YER090W 1524 nt7.4□□□□□ -1.22
NSE4P43124 ALP1YNL270C 1722 nt7.39□□□□□ -1.23
NSE4P43124 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.39□□□□□ -1.23
NSE4P43124 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.39□□□□□ -1.23
NSE4P43124 RSC4YKR008W 1878 nt7.38□□□□□ -1.23
NSE4P43124 TAT2YOL020W 1779 nt7.37□□□□□ -1.23
NSE4P43124 THI6YPL214C 1623 nt7.37□□□□□ -1.23
NSE4P43124 SRM1YGL097W 1449 nt7.36□□□□□ -1.23
NSE4P43124 PFS2YNL317W 1398 nt7.36□□□□□ -1.23
NSE4P43124 YDR010CYDR010C 333 nt7.36□□□□□ -1.23
NSE4P43124 MET28YIR017C 564 nt7.36□□□□□ -1.23
NSE4P43124 HXT12YIL170W 1374 nt7.35□□□□□ -1.23
NSE4P43124 SNX3YOR357C 489 nt7.35□□□□□ -1.23
NSE4P43124 PEX25YPL112C 1185 nt7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms