Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.41□□□□□ -0.9
UFE1P41834 CCT5YJR064W 1689 nt9.4□□□□□ -0.9
UFE1P41834 SSN3YPL042C 1668 nt9.4□□□□□ -0.9
UFE1P41834 PHO23YNL097C 993 nt9.39□□□□□ -0.91
UFE1P41834 GND2YGR256W 1479 nt9.39□□□□□ -0.91
UFE1P41834 BIO5YNR056C 1686 nt9.39□□□□□ -0.91
UFE1P41834 UFO1YML088W 2007 nt9.38□□□□□ -0.91
UFE1P41834 YJL118WYJL118W 660 nt9.38□□□□□ -0.91
UFE1P41834 NUC1YJL208C 990 nt9.38□□□□□ -0.91
UFE1P41834 RPT5YOR117W 1305 nt9.36□□□□□ -0.91
UFE1P41834 BNI5YNL166C 1347 nt9.35□□□□□ -0.91
UFE1P41834 GAL3YDR009W 1563 nt9.35□□□□□ -0.91
UFE1P41834 URA6YKL024C 615 nt9.35□□□□□ -0.91
UFE1P41834 SEC61YLR378C 1443 nt9.34□□□□□ -0.91
UFE1P41834 RIB7YBR153W 735 nt9.34□□□□□ -0.91
UFE1P41834 MSC1YML128C 1542 nt9.34□□□□□ -0.91
UFE1P41834 ZRT3YKL175W 1512 nt9.33□□□□□ -0.92
UFE1P41834 SAM2YDR502C 1155 nt9.33□□□□□ -0.92
UFE1P41834 OXA1YER154W 1209 nt9.33□□□□□ -0.92
UFE1P41834 SAM3YPL274W 1764 nt9.32□□□□□ -0.92
UFE1P41834 PGC1YPL206C 966 nt9.32□□□□□ -0.92
UFE1P41834 OYE3YPL171C 1203 nt9.31□□□□□ -0.92
UFE1P41834 PAU5YFL020C 369 nt9.3□□□□□ -0.92
UFE1P41834 NAP1YKR048C 1254 nt9.3□□□□□ -0.92
UFE1P41834 SEN2YLR105C 1134 nt9.3□□□□□ -0.92
UFE1P41834 NAR1YNL240C 1476 nt9.29□□□□□ -0.92
UFE1P41834 THI72YOR192C 1800 nt9.29□□□□□ -0.92
UFE1P41834 STP3YLR375W 1032 nt9.29□□□□□ -0.92
UFE1P41834 TAF13YML098W 504 nt9.29□□□□□ -0.92
UFE1P41834 YBR232CYBR232C 360 nt9.29□□□□□ -0.92
UFE1P41834 PET8YNL003C 855 nt9.27□□□□□ -0.93
UFE1P41834 YER188WYER188W 720 nt9.26□□□□□ -0.93
UFE1P41834 HSL7YBR133C 2484 nt9.25□□□□□ -0.93
UFE1P41834 CMP2YML057W 1815 nt9.25□□□□□ -0.93
UFE1P41834 MET2YNL277W 1461 nt9.25□□□□□ -0.93
UFE1P41834 FUB1YCR076C 753 nt9.24□□□□□ -0.93
UFE1P41834 HEL2YDR266C 1920 nt9.24□□□□□ -0.93
UFE1P41834 OYE2YHR179W 1203 nt9.23□□□□□ -0.93
UFE1P41834 SNZ1YMR096W 894 nt9.23□□□□□ -0.93
UFE1P41834 RAS2YNL098C 969 nt9.22□□□□□ -0.93
UFE1P41834 TPS1YBR126C 1488 nt9.21□□□□□ -0.93
UFE1P41834 PUP1YOR157C 786 nt9.21□□□□□ -0.94
UFE1P41834 YPR126CYPR126C 309 nt9.21□□□□□ -0.94
UFE1P41834 MHF1YOL086W-A 273 nt9.2□□□□□ -0.94
UFE1P41834 GID7YCL039W 2238 nt9.19□□□□□ -0.94
UFE1P41834 DLD2YDL178W 1593 nt9.18□□□□□ -0.94
UFE1P41834 EAF3YPR023C 1206 nt9.18□□□□□ -0.94
UFE1P41834 DAK2YFL053W 1776 nt9.17□□□□□ -0.94
UFE1P41834 YJL067WYJL067W 351 nt9.17□□□□□ -0.94
UFE1P41834 YMR262WYMR262W 942 nt9.17□□□□□ -0.94
UFE1P41834 PBP1YGR178C 2169 nt9.17□□□□□ -0.94
UFE1P41834 FLR1YBR008C 1647 nt9.16□□□□□ -0.94
UFE1P41834 YAT1YAR035W 2064 nt9.16□□□□□ -0.94
UFE1P41834 POT1YIL160C 1254 nt9.16□□□□□ -0.94
UFE1P41834 GSF2YML048W 1212 nt9.16□□□□□ -0.94
UFE1P41834 YJL064WYJL064W 396 nt9.15□□□□□ -0.94
UFE1P41834 RSC8YFR037C 1674 nt9.14□□□□□ -0.95
UFE1P41834 IML3YBR107C 738 nt9.14□□□□□ -0.95
UFE1P41834 OSH7YHR001W 1314 nt9.13□□□□□ -0.95
UFE1P41834 PAR32YDL173W 888 nt9.13□□□□□ -0.95
UFE1P41834 PAU19YMR325W 375 nt9.13□□□□□ -0.95
UFE1P41834 YPS3YLR121C 1527 nt9.13□□□□□ -0.95
UFE1P41834 CTI6YPL181W 1521 nt9.13□□□□□ -0.95
UFE1P41834 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.12□□□□□ -0.95
UFE1P41834 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.12□□□□□ -0.95
UFE1P41834 FMS1YMR020W 1527 nt9.12□□□□□ -0.95
UFE1P41834 CYT2YKL087C 675 nt9.12□□□□□ -0.95
UFE1P41834 TMA23YMR269W 636 nt9.11□□□□□ -0.95
UFE1P41834 YNL024CYNL024C 741 nt9.11□□□□□ -0.95
UFE1P41834 TUB4YLR212C 1422 nt9.1□□□□□ -0.95
UFE1P41834 SFP1YLR403W 2052 nt9.09□□□□□ -0.95
UFE1P41834 SPP2YOR148C 558 nt9.08□□□□□ -0.96
UFE1P41834 HEM13YDR044W 987 nt9.07□□□□□ -0.96
UFE1P41834 CWC15YDR163W 528 nt9.07□□□□□ -0.96
UFE1P41834 SOL2YCR073W-A 948 nt9.06□□□□□ -0.96
UFE1P41834 DDI1YER143W 1287 nt9.06□□□□□ -0.96
UFE1P41834 IMO32YGR031W 1029 nt9.06□□□□□ -0.96
UFE1P41834 NPP1YCR026C 2229 nt9.04□□□□□ -0.96
UFE1P41834 APS2YJR058C 444 nt9.04□□□□□ -0.96
UFE1P41834 LSM5YER146W 282 nt9.03□□□□□ -0.96
UFE1P41834 NIF3YGL221C 867 nt9.03□□□□□ -0.96
UFE1P41834 TIM44YIL022W 1296 nt9.03□□□□□ -0.96
UFE1P41834 ACH1YBL015W 1581 nt9.02□□□□□ -0.97
UFE1P41834 VPS62YGR141W 1404 nt9□□□□□ -0.97
UFE1P41834 RRT8YOL048C 1029 nt9□□□□□ -0.97
UFE1P41834 SPS100YHR139C 981 nt8.99□□□□□ -0.97
UFE1P41834 SLG1YOR008C 1137 nt8.99□□□□□ -0.97
UFE1P41834 TAT2YOL020W 1779 nt8.99□□□□□ -0.97
UFE1P41834 TIP1YBR067C 633 nt8.97□□□□□ -0.97
UFE1P41834 YDR455CYDR455C 309 nt8.96□□□□□ -0.98
UFE1P41834 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
UFE1P41834 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
UFE1P41834 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
UFE1P41834 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
UFE1P41834 YDL086WYDL086W 822 nt8.95□□□□□ -0.98
UFE1P41834 ADE8YDR408C 645 nt8.94□□□□□ -0.98
UFE1P41834 IGD1YFR017C 588 nt8.94□□□□□ -0.98
UFE1P41834 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.94□□□□□ -0.98
UFE1P41834 INA1YLR413W 2028 nt8.92□□□□□ -0.98
UFE1P41834 FRE6YLL051C 2139 nt8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.3 ms