Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 HXT1YHR094C 1713 nt12.91□□□□□ -0.34
PDR11P40550 GND2YGR256W 1479 nt12.91□□□□□ -0.34
PDR11P40550 TIM44YIL022W 1296 nt12.9□□□□□ -0.34
PDR11P40550 SSN3YPL042C 1668 nt12.89□□□□□ -0.35
PDR11P40550 BNI5YNL166C 1347 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR11P40550 PAU19YMR325W 375 nt12.87□□□□□ -0.35
PDR11P40550 SLG1YOR008C 1137 nt12.87□□□□□ -0.35
PDR11P40550 HIF1YLL022C 1158 nt12.84□□□□□ -0.35
PDR11P40550 LSB5YCL034W 1065 nt12.84□□□□□ -0.35
PDR11P40550 LEU9YOR108W 1815 nt12.84□□□□□ -0.35
PDR11P40550 STP3YLR375W 1032 nt12.81□□□□□ -0.36
PDR11P40550 YMR262WYMR262W 942 nt12.8□□□□□ -0.36
PDR11P40550 RIB1YBL033C 1038 nt12.78□□□□□ -0.36
PDR11P40550 UFO1YML088W 2007 nt12.77□□□□□ -0.36
PDR11P40550 TRT2tT(CGU)K 72 nt12.77□□□□□ -0.37
PDR11P40550 NUC1YJL208C 990 nt12.77□□□□□ -0.37
PDR11P40550 RPT5YOR117W 1305 nt12.76□□□□□ -0.37
PDR11P40550 SHY1YGR112W 1170 nt12.76□□□□□ -0.37
PDR11P40550 APS2YJR058C 444 nt12.76□□□□□ -0.37
PDR11P40550 BOR1YNL275W 1731 nt12.76□□□□□ -0.37
PDR11P40550 TPS1YBR126C 1488 nt12.75□□□□□ -0.37
PDR11P40550 ERG6YML008C 1152 nt12.75□□□□□ -0.37
PDR11P40550 TIP1YBR067C 633 nt12.74□□□□□ -0.37
PDR11P40550 TAF13YML098W 504 nt12.71□□□□□ -0.37
PDR11P40550 PHO23YNL097C 993 nt12.71□□□□□ -0.37
PDR11P40550 MSC1YML128C 1542 nt12.68□□□□□ -0.38
PDR11P40550 YPR126CYPR126C 309 nt12.68□□□□□ -0.38
PDR11P40550 BIO5YNR056C 1686 nt12.66□□□□□ -0.38
PDR11P40550 SAM2YDR502C 1155 nt12.65□□□□□ -0.38
PDR11P40550 SOD2YHR008C 702 nt12.65□□□□□ -0.38
PDR11P40550 RIB7YBR153W 735 nt12.64□□□□□ -0.39
PDR11P40550 CTI6YPL181W 1521 nt12.64□□□□□ -0.39
PDR11P40550 TUB4YLR212C 1422 nt12.64□□□□□ -0.39
PDR11P40550 OYE3YPL171C 1203 nt12.63□□□□□ -0.39
PDR11P40550 FLR1YBR008C 1647 nt12.63□□□□□ -0.39
PDR11P40550 FUB1YCR076C 753 nt12.62□□□□□ -0.39
PDR11P40550 DDI1YER143W 1287 nt12.62□□□□□ -0.39
PDR11P40550 OYE2YHR179W 1203 nt12.61□□□□□ -0.39
PDR11P40550 RAS2YNL098C 969 nt12.61□□□□□ -0.39
PDR11P40550 EAF3YPR023C 1206 nt12.59□□□□□ -0.39
PDR11P40550 YIA6YIL006W 1122 nt12.58□□□□□ -0.4
PDR11P40550 YER188WYER188W 720 nt12.57□□□□□ -0.4
PDR11P40550 NIF3YGL221C 867 nt12.56□□□□□ -0.4
PDR11P40550 POT1YIL160C 1254 nt12.56□□□□□ -0.4
PDR11P40550 MHF1YOL086W-A 273 nt12.56□□□□□ -0.4
PDR11P40550 DAK2YFL053W 1776 nt12.56□□□□□ -0.4
PDR11P40550 SEC61YLR378C 1443 nt12.54□□□□□ -0.4
PDR11P40550 QDR2YIL121W 1629 nt12.54□□□□□ -0.4
PDR11P40550 PAR32YDL173W 888 nt12.53□□□□□ -0.4
PDR11P40550 DLD2YDL178W 1593 nt12.52□□□□□ -0.4
PDR11P40550 URA6YKL024C 615 nt12.51□□□□□ -0.41
PDR11P40550 GSF2YML048W 1212 nt12.51□□□□□ -0.41
PDR11P40550 TMA23YMR269W 636 nt12.51□□□□□ -0.41
PDR11P40550 LSM5YER146W 282 nt12.5□□□□□ -0.41
PDR11P40550 CDD1YLR245C 429 nt12.5□□□□□ -0.41
PDR11P40550 POP2YNR052C 1302 nt12.49□□□□□ -0.41
PDR11P40550 RSC8YFR037C 1674 nt12.46□□□□□ -0.41
PDR11P40550 YDR455CYDR455C 309 nt12.45□□□□□ -0.42
PDR11P40550 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt12.45□□□□□ -0.42
PDR11P40550 NAS2YIL007C 663 nt12.45□□□□□ -0.42
PDR11P40550 TAT2YOL020W 1779 nt12.45□□□□□ -0.42
PDR11P40550 HEM13YDR044W 987 nt12.44□□□□□ -0.42
PDR11P40550 PET8YNL003C 855 nt12.44□□□□□ -0.42
PDR11P40550 YPS3YLR121C 1527 nt12.43□□□□□ -0.42
PDR11P40550 FMS1YMR020W 1527 nt12.43□□□□□ -0.42
PDR11P40550 SOL2YCR073W-A 948 nt12.42□□□□□ -0.42
PDR11P40550 YER152W-AYER152W-A 567 nt12.42□□□□□ -0.42
PDR11P40550 OXA1YER154W 1209 nt12.42□□□□□ -0.42
PDR11P40550 YJL067WYJL067W 351 nt12.42□□□□□ -0.42
PDR11P40550 IML3YBR107C 738 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR11P40550 IGD1YFR017C 588 nt12.4□□□□□ -0.42
PDR11P40550 SPP2YOR148C 558 nt12.4□□□□□ -0.42
PDR11P40550 OSH7YHR001W 1314 nt12.4□□□□□ -0.42
PDR11P40550 YNL024CYNL024C 741 nt12.38□□□□□ -0.43
PDR11P40550 IMO32YGR031W 1029 nt12.35□□□□□ -0.43
PDR11P40550 ZRT3YKL175W 1512 nt12.34□□□□□ -0.43
PDR11P40550 SPS100YHR139C 981 nt12.33□□□□□ -0.44
PDR11P40550 SAM50YNL026W 1455 nt12.33□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR11P40550 LYS20YDL182W 1287 nt12.29□□□□□ -0.44
PDR11P40550 ADE8YDR408C 645 nt12.29□□□□□ -0.44
PDR11P40550 NVJ2YPR091C 2313 nt12.29□□□□□ -0.44
PDR11P40550 YCP4YCR004C 744 nt12.28□□□□□ -0.44
PDR11P40550 YCR025CYCR025C 411 nt12.28□□□□□ -0.44
PDR11P40550 BUD20YLR074C 501 nt12.28□□□□□ -0.44
PDR11P40550 SPE2YOL052C 1191 nt12.28□□□□□ -0.44
PDR11P40550 ACO2YJL200C 2370 nt12.27□□□□□ -0.44
PDR11P40550 ACH1YBL015W 1581 nt12.27□□□□□ -0.45
PDR11P40550 KRE1YNL322C 942 nt12.27□□□□□ -0.45
PDR11P40550 IPL1YPL209C 1104 nt12.26□□□□□ -0.45
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