Protein–RNA interactions for Protein: P38351

PAF1, RNA polymerase II-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAF1P38351 SSN3YPL042C 1668 nt12.89□□□□□ -0.35
PAF1P38351 SHY1YGR112W 1170 nt12.88□□□□□ -0.35
PAF1P38351 TRT2tT(CGU)K 72 nt12.87□□□□□ -0.35
PAF1P38351 NUC1YJL208C 990 nt12.87□□□□□ -0.35
PAF1P38351 CCT5YJR064W 1689 nt12.86□□□□□ -0.35
PAF1P38351 YJL118WYJL118W 660 nt12.84□□□□□ -0.35
PAF1P38351 BIO5YNR056C 1686 nt12.83□□□□□ -0.35
PAF1P38351 RPT5YOR117W 1305 nt12.83□□□□□ -0.36
PAF1P38351 PHO23YNL097C 993 nt12.82□□□□□ -0.36
PAF1P38351 BNI5YNL166C 1347 nt12.82□□□□□ -0.36
PAF1P38351 UFO1YML088W 2007 nt12.81□□□□□ -0.36
PAF1P38351 SAM2YDR502C 1155 nt12.81□□□□□ -0.36
PAF1P38351 RIB7YBR153W 735 nt12.8□□□□□ -0.36
PAF1P38351 SEC61YLR378C 1443 nt12.79□□□□□ -0.36
PAF1P38351 GAL3YDR009W 1563 nt12.78□□□□□ -0.36
PAF1P38351 URA6YKL024C 615 nt12.78□□□□□ -0.36
PAF1P38351 PAU5YFL020C 369 nt12.77□□□□□ -0.37
PAF1P38351 MSC1YML128C 1542 nt12.77□□□□□ -0.37
PAF1P38351 OYE3YPL171C 1203 nt12.76□□□□□ -0.37
PAF1P38351 ZRT3YKL175W 1512 nt12.76□□□□□ -0.37
PAF1P38351 SEN2YLR105C 1134 nt12.75□□□□□ -0.37
PAF1P38351 THI72YOR192C 1800 nt12.74□□□□□ -0.37
PAF1P38351 OXA1YER154W 1209 nt12.74□□□□□ -0.37
PAF1P38351 TAF13YML098W 504 nt12.74□□□□□ -0.37
PAF1P38351 PGC1YPL206C 966 nt12.74□□□□□ -0.37
PAF1P38351 SAM3YPL274W 1764 nt12.74□□□□□ -0.37
PAF1P38351 NAP1YKR048C 1254 nt12.73□□□□□ -0.37
PAF1P38351 STP3YLR375W 1032 nt12.71□□□□□ -0.37
PAF1P38351 PET8YNL003C 855 nt12.71□□□□□ -0.37
PAF1P38351 YBR232CYBR232C 360 nt12.69□□□□□ -0.38
PAF1P38351 YER188WYER188W 720 nt12.68□□□□□ -0.38
PAF1P38351 RAS2YNL098C 969 nt12.68□□□□□ -0.38
PAF1P38351 TPS1YBR126C 1488 nt12.65□□□□□ -0.38
PAF1P38351 FUB1YCR076C 753 nt12.64□□□□□ -0.39
PAF1P38351 OYE2YHR179W 1203 nt12.64□□□□□ -0.39
PAF1P38351 SNZ1YMR096W 894 nt12.63□□□□□ -0.39
PAF1P38351 PUP1YOR157C 786 nt12.61□□□□□ -0.39
PAF1P38351 DLD2YDL178W 1593 nt12.58□□□□□ -0.4
PAF1P38351 YMR262WYMR262W 942 nt12.58□□□□□ -0.4
PAF1P38351 MHF1YOL086W-A 273 nt12.58□□□□□ -0.4
PAF1P38351 YPR126CYPR126C 309 nt12.58□□□□□ -0.4
PAF1P38351 EAF3YPR023C 1206 nt12.57□□□□□ -0.4
PAF1P38351 YJL067WYJL067W 351 nt12.56□□□□□ -0.4
PAF1P38351 POT1YIL160C 1254 nt12.55□□□□□ -0.4
PAF1P38351 YJL064WYJL064W 396 nt12.55□□□□□ -0.4
PAF1P38351 FLR1YBR008C 1647 nt12.55□□□□□ -0.4
PAF1P38351 DAK2YFL053W 1776 nt12.53□□□□□ -0.4
PAF1P38351 NAR1YNL240C 1476 nt12.53□□□□□ -0.4
PAF1P38351 RSC8YFR037C 1674 nt12.52□□□□□ -0.4
PAF1P38351 IML3YBR107C 738 nt12.52□□□□□ -0.41
PAF1P38351 OSH7YHR001W 1314 nt12.52□□□□□ -0.41
PAF1P38351 CTI6YPL181W 1521 nt12.52□□□□□ -0.41
PAF1P38351 GSF2YML048W 1212 nt12.51□□□□□ -0.41
PAF1P38351 YNL024CYNL024C 741 nt12.51□□□□□ -0.41
PAF1P38351 PAU19YMR325W 375 nt12.5□□□□□ -0.41
PAF1P38351 YPS3YLR121C 1527 nt12.5□□□□□ -0.41
PAF1P38351 FMS1YMR020W 1527 nt12.49□□□□□ -0.41
PAF1P38351 PAR32YDL173W 888 nt12.49□□□□□ -0.41
PAF1P38351 PBP1YGR178C 2169 nt12.49□□□□□ -0.41
PAF1P38351 TMA23YMR269W 636 nt12.48□□□□□ -0.41
PAF1P38351 CWC15YDR163W 528 nt12.45□□□□□ -0.42
PAF1P38351 CYT2YKL087C 675 nt12.45□□□□□ -0.42
PAF1P38351 SPP2YOR148C 558 nt12.45□□□□□ -0.42
PAF1P38351 TUB4YLR212C 1422 nt12.45□□□□□ -0.42
PAF1P38351 SOL2YCR073W-A 948 nt12.44□□□□□ -0.42
PAF1P38351 DDI1YER143W 1287 nt12.44□□□□□ -0.42
PAF1P38351 LSM5YER146W 282 nt12.43□□□□□ -0.42
PAF1P38351 HEM13YDR044W 987 nt12.4□□□□□ -0.42
PAF1P38351 APS2YJR058C 444 nt12.4□□□□□ -0.42
PAF1P38351 IMO32YGR031W 1029 nt12.39□□□□□ -0.43
PAF1P38351 TIM44YIL022W 1296 nt12.36□□□□□ -0.43
PAF1P38351 NIF3YGL221C 867 nt12.35□□□□□ -0.43
PAF1P38351 SLG1YOR008C 1137 nt12.34□□□□□ -0.43
PAF1P38351 VPS62YGR141W 1404 nt12.34□□□□□ -0.43
PAF1P38351 SPS100YHR139C 981 nt12.33□□□□□ -0.44
PAF1P38351 TIP1YBR067C 633 nt12.32□□□□□ -0.44
PAF1P38351 ACH1YBL015W 1581 nt12.31□□□□□ -0.44
PAF1P38351 TAT2YOL020W 1779 nt12.3□□□□□ -0.44
PAF1P38351 ASP3-1YLR155C 1089 nt12.29□□□□□ -0.44
PAF1P38351 ASP3-2YLR157C 1089 nt12.29□□□□□ -0.44
PAF1P38351 ASP3-3YLR158C 1089 nt12.29□□□□□ -0.44
PAF1P38351 ASP3-4YLR160C 1089 nt12.29□□□□□ -0.44
PAF1P38351 YDR455CYDR455C 309 nt12.28□□□□□ -0.44
PAF1P38351 RRT8YOL048C 1029 nt12.28□□□□□ -0.44
PAF1P38351 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt12.27□□□□□ -0.45
PAF1P38351 YDL086WYDL086W 822 nt12.25□□□□□ -0.45
PAF1P38351 ADE8YDR408C 645 nt12.25□□□□□ -0.45
PAF1P38351 IGD1YFR017C 588 nt12.24□□□□□ -0.45
PAF1P38351 ERG13YML126C 1476 nt12.22□□□□□ -0.45
PAF1P38351 INA1YLR413W 2028 nt12.22□□□□□ -0.45
PAF1P38351 KRE1YNL322C 942 nt12.21□□□□□ -0.45
PAF1P38351 RDN25-1RDN25-1 3396 nt12.21□□□□□ -0.45
PAF1P38351 RDN25-2RDN25-2 3396 nt12.21□□□□□ -0.45
PAF1P38351 ABZ2YMR289W 1125 nt12.19□□□□□ -0.46
PAF1P38351 TVP23YDR084C 600 nt12.18□□□□□ -0.46
PAF1P38351 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt12.18□□□□□ -0.46
PAF1P38351 YAT1YAR035W 2064 nt12.16□□□□□ -0.46
PAF1P38351 YJR114WYJR114W 393 nt12.16□□□□□ -0.46
PAF1P38351 CMP2YML057W 1815 nt12.15□□□□□ -0.46
PAF1P38351 RIB1YBL033C 1038 nt12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.4 ms