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Protein–RNA interactions for Protein: P35209
SPT21, Protein SPT21, yeast
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758 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SPT21
P35209
YKR104W
YKR104W
921 nt
13.24
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
YPR150W
YPR150W
522 nt
13.24
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
IRC15
YPL017C
1500 nt
13.23
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
MHO1
YJR008W
1017 nt
13.23
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
YKL030W
YKL030W
606 nt
13.23
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
TFB4
YPR056W
1017 nt
13.23
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
VHS2
YIL135C
1311 nt
13.22
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
VAC17
YCL063W
1272 nt
13.22
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
RAI1
YGL246C
1164 nt
13.22
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
YHR022C
YHR022C
771 nt
13.22
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
RTS2
YOR077W
699 nt
13.22
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
DSC2
YOL073C
969 nt
13.21
□□□□□ -0.29
SPT21
P35209
EEB1
YPL095C
1371 nt
13.2
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
MGR3
YMR115W
1506 nt
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SPT21
P35209
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YLR235C
399 nt
13.2
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
END3
YNL084C
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13.2
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
ATG29
YPL166W
642 nt
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□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
FES1
YBR101C
873 nt
13.2
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
RTC4
YNL254C
1206 nt
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SPT21
P35209
YPL068C
YPL068C
882 nt
13.19
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
YJL211C
YJL211C
444 nt
13.18
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
YPR027C
YPR027C
834 nt
13.18
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
ISA2
YPR067W
558 nt
13.18
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SPT21
P35209
YCL042W
YCL042W
360 nt
13.18
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
FSH1
YHR049W
732 nt
13.17
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
CWC25
YNL245C
540 nt
13.17
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
PRE2
YPR103W
864 nt
13.17
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
SDH1
YKL148C
1923 nt
13.17
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
YLR412C-A
YLR412C-A
207 nt
13.16
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
CUE1
YMR264W
612 nt
13.16
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
LCB1
YMR296C
1677 nt
13.15
□□□□□ -0.3
SPT21
P35209
YAP6
YDR259C
1152 nt
13.14
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
YDL221W
YDL221W
552 nt
13.13
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
YFR045W
YFR045W
930 nt
13.13
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
DCI1
YOR180C
816 nt
13.13
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
COX11
YPL132W
903 nt
13.12
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
ALG7
YBR243C
1347 nt
13.12
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
TRP4
YDR354W
1143 nt
13.1
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
FMP52
YER004W
696 nt
13.1
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
NDL1
YLR254C
570 nt
13.1
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
YMR075C-A
YMR075C-A
366 nt
13.1
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
OCA1
YNL099C
717 nt
13.1
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
SET6
YPL165C
1122 nt
13.1
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
BRL1
YHR036W
1416 nt
13.1
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
GIS3
YLR094C
1509 nt
13.09
□□□□□ -0.31
SPT21
P35209
YDR029W
YDR029W
315 nt
13.08
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
ENT5
YDR153C
1236 nt
13.08
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
REX3
YLR107W
1215 nt
13.08
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
YLR285C-A
YLR285C-A
171 nt
13.08
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
PCD1
YLR151C
1023 nt
13.07
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
RRP40
YOL142W
723 nt
13.07
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
UBS1
YBR165W
834 nt
13.07
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
YLH47
YPR125W
1365 nt
13.07
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
SEC11
YIR022W
504 nt
13.06
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
TVP38
YKR088C
1014 nt
13.06
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
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13.06
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
COG5
YNL051W
1212 nt
13.06
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
ERJ5
YFR041C
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13.05
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
IDP3
YNL009W
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13.05
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
KDX1
YKL161C
1302 nt
13.05
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
UBC5
YDR059C
447 nt
13.04
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
RMD5
YDR255C
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13.04
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
TAP42
YMR028W
1101 nt
13.04
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
PCL1
YNL289W
840 nt
13.04
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
YLR460C
YLR460C
1131 nt
13.03
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
YMR090W
YMR090W
684 nt
13.03
□□□□□ -0.32
SPT21
P35209
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YDR541C
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□□□□□ -0.33
SPT21
P35209
SLM4
YBR077C
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13.02
□□□□□ -0.33
SPT21
P35209
RPN9
YDR427W
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□□□□□ -0.33
SPT21
P35209
YFR018C
YFR018C
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13.01
□□□□□ -0.33
SPT21
P35209
RRT6
YGL146C
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SPT21
P35209
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SPT21
P35209
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YMR181C
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SPT21
P35209
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P35209
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SPT21
P35209
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SPT21
P35209
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YOR306C
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SPT21
P35209
snR56
snR56
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SPT21
P35209
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SPT21
P35209
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SPT21
P35209
YNL165W
YNL165W
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SPT21
P35209
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P35209
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SPT21
P35209
YDR220C
YDR220C
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□□□□□ -0.33
SPT21
P35209
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P35209
DCP1
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SPT21
P35209
PAU16
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SPT21
P35209
SPG5
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SPT21
P35209
YIL092W
YIL092W
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□□□□□ -0.33
SPT21
P35209
SPC24
YMR117C
642 nt
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□□□□□ -0.33
SPT21
P35209
YOL038C-A
YOL038C-A
96 nt
12.96
□□□□□ -0.33
SPT21
P35209
BOR1
YNL275W
1731 nt
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SPT21
P35209
RPC53
YDL150W
1269 nt
12.95
□□□□□ -0.34
SPT21
P35209
PTC7
YHR076W
1032 nt
12.95
□□□□□ -0.34
SPT21
P35209
YDL121C
YDL121C
450 nt
12.94
□□□□□ -0.34
SPT21
P35209
tL(GAG)G
tL(GAG)G
82 nt
12.94
□□□□□ -0.34
SPT21
P35209
YAL026C-A
YAL026C-A
438 nt
12.94
□□□□□ -0.34
SPT21
P35209
SBA1
YKL117W
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12.94
□□□□□ -0.34
SPT21
P35209
BMT6
YLR063W
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12.94
□□□□□ -0.34
SPT21
P35209
TIM23
YNR017W
669 nt
12.94
□□□□□ -0.34
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