Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP58Q9Y2X3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms