Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms