Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF1CQ15572 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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