Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 RGR1YLR071C 3249 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 CWH41YGL027C 2502 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 PRP18YGR006W 756 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 MRPL9YGR220C 810 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 YLL047WYLL047W 384 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 YNL043CYNL043C 321 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 ATG34YOL083W 1239 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 YOR203WYOR203W 354 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 RIT1YMR283C 1542 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 BNR1YIL159W 4128 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 AIM6YDL237W 1173 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 SAW1YAL027W 786 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 NNT1YLR285W 786 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 VMA6YLR447C 1038 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 INO4YOL108C 456 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 YOL114CYOL114C 609 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 RRP14YKL082C 1305 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 YLR278CYLR278C 4026 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 ATP22YDR350C 2055 nt2.56□□□□□ -2
SNF8Q12483 VAC14YLR386W 2643 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 HBT1YDL223C 3141 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 CAF120YNL278W 3183 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 RRI1YDL216C 1323 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 RPL24BYGR148C 468 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 RPL14BYHL001W 417 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 LSM8YJR022W 330 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 AYT1YLL063C 1425 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 SST2YLR452C 2097 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 KAR5YMR065W 1515 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 MAK5YBR142W 2322 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 YPL150WYPL150W 2706 nt2.55□□□□□ -2
SNF8Q12483 AVT5YBL089W 1380 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 HMO1YDR174W 741 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 TCA17YEL048C 459 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 HPA3YEL066W 540 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 TCD1YHR003C 1290 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 RPL17BYJL177W 555 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 HOT13YKL084W 351 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 COA4YLR218C 453 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 PSY3YLR376C 729 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 COX14YML129C 213 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 MSN1YOL116W 1149 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 YOL166CYOL166C 339 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 SUT2YPR009W 807 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 LTP1YPR073C 486 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 CBP2YHL038C 1893 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 SAP1YER047C 2694 nt2.54□□□□□ -2
SNF8Q12483 TRA1YHR099W 11235 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 RPL27AYHR010W 411 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 ERG20YJL167W 1059 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 YJR071WYJR071W 369 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 ARC19YKL013C 516 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 RIF2YLR453C 1188 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 BET5YML077W 480 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 IZH4YOL101C 939 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 TPT1YOL102C 693 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 CTP1YBR291C 900 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 CWC22YGR278W 1734 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 SWR1YDR334W 4545 nt2.53□□□□□ -2
SNF8Q12483 NAB3YPL190C 2409 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 MSH4YFL003C 2637 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 KIN82YCR091W 2163 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 RPA12YJR063W 378 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 SUB1YMR039C 879 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YNL171CYNL171C 369 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YNL234WYNL234W 1281 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 ATG3YNR007C 933 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 THI80YOR143C 960 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YOR387CYOR387C 621 nt2.52□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 FRE8YLR047C 2061 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 ORC1YML065W 2745 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YHR078WYHR078W 1659 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 COBQ0105 1158 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YGL159WYGL159W 1113 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YIL054WYIL054W 318 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 OMA1YKR087C 1038 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 ERV41YML067C 1059 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 ECM13YBL043W 774 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 MRPL33YMR286W 261 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.51□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 AI4Q0065 1671 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 VPS30YPL120W 1674 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 NSA1YGL111W 1392 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YDR239CYDR239C 2364 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 AI3Q0060 1248 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 MST27YGL051W 705 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 UPF3YGR072W 1164 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 BAT1YHR208W 1182 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 MMF1YIL051C 438 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 SRL1YOR247W 633 nt2.5□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YBR259WYBR259W 2067 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 SLY41YOR307C 1362 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YJL132WYJL132W 2253 nt2.49□□□□□ -2.01
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