Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA4P43358 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAGEA4P43358 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAGEA4P43358 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAGEA4P43358 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MAGEA4P43358 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAGEA4P43358 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms