Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 VHR2YER064C 1518 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YDR061WYDR061W 1620 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 KHA1YJL094C 2622 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 KAP104YBR017C 2757 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 COG7YGL005C 840 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YGR160WYGR160W 612 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 LSM12YHR121W 564 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 DAD2YKR083C 402 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 GCY1YOR120W 939 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 TAF3YPL011C 1062 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 TIM12YBR091C 330 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 snR42snR42 351 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YCL019WYCL019W 5313 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 STN1YDR082W 1485 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 PAM1YDR251W 2493 nt3.07□□□□□ -1.92
SEC28P40509 RSN1YMR266W 2862 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 SYO1YDL063C 1863 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 DTD1YDL219W 453 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 BMH2YDR099W 822 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 HMO1YDR174W 741 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YPR1YDR368W 939 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 DYN2YDR424C 279 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 MSH4YFL003C 2637 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 SEC4YFL005W 648 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YGR111WYGR111W 1203 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YJL169WYJL169W 369 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 PIR1YKL164C 1026 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 SED5YLR026C 1023 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YNL043CYNL043C 321 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 VAC14YLR386W 2643 nt3.06□□□□□ -1.92
SEC28P40509 TRM82YDR165W 1335 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YMR046CYMR046C 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 STE6YKL209C 3873 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YGL159WYGL159W 1113 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YHR212CYHR212C 336 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YJL175WYJL175W 513 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YAR060CYAR060C 336 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 DIA1YMR316W 1011 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 snR35snR35 204 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 AIM4YBR194W 372 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 SNQ2YDR011W 4506 nt3.05□□□□□ -1.92
SEC28P40509 SPO14YKR031C 5052 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 AVT2YEL064C 1443 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 COM2YER130C 1332 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 KAR1YNL188W 1302 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 NRG1YDR043C 696 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 INP1YMR204C 1263 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 RPL20AYMR242C 519 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YPR027CYPR027C 834 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 ITC1YGL133W 3795 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 ART10YLR392C 1557 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 POL2YNL262W 6669 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC28P40509 SOK1YDR006C 2706 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 JJJ1YNL227C 1773 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 TVP15YDR100W 432 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YGL204CYGL204C 306 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YHL005CYHL005C 393 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 AIM23YJL131C 1071 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 SDH3YKL141W 597 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 SRL3YKR091W 741 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YBL055CYBL055C 1257 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 MRPL17YNL252C 846 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 NET1YJL076W 3570 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YDR090CYDR090C 933 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 CPR5YDR304C 678 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 EMI1YDR512C 564 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 VMA10YHR039C-A 345 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 DSE2YHR143W 978 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YJR056CYJR056C 711 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YLR230WYLR230W 306 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YNL013CYNL013C 378 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 NOP56YLR197W 1515 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 PSY2YNL201C 2577 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC28P40509 RGR1YLR071C 3249 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 KRE2YDR483W 1329 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 SHR3YDL212W 633 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 HLR1YDR528W 1272 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YGL242CYGL242C 546 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YHR180WYHR180W 492 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YJL114WYJL114W 681 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 ERG20YJL167W 1059 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 REC102YLR329W 795 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 MER1YNL210W 813 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 THI80YOR143C 960 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 RPL20BYOR312C 519 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 ARO4YBR249C 1113 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 MDM10YAL010C 1482 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC28P40509 NMD2YHR077C 3270 nt3□□□□□ -1.93
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