Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 SRL1YOR247W 633 nt2.59□□□□□ -1.99
DDI1P40087 LTP1YPR073C 486 nt2.59□□□□□ -1.99
DDI1P40087 SKO1YNL167C 1944 nt2.59□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RRP14YKL082C 1305 nt2.59□□□□□ -2
DDI1P40087 DSF2YBR007C 2211 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 DSE4YNR067C 3354 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 MMS1YPR164W 4224 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 AXL1YPR122W 3627 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 YCK2YNL154C 1641 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 DTD1YDL219W 453 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 YDR193WYDR193W 399 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 LSM8YJR022W 330 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 DAD2YKR083C 402 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 VMA6YLR447C 1038 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 RIF2YLR453C 1188 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 YNL234WYNL234W 1281 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 YOR387CYOR387C 621 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 SAD1YFR005C 1347 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 VHR2YER064C 1518 nt2.58□□□□□ -2
DDI1P40087 KEL2YGR238C 2649 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 PSK1YAL017W 4071 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 ERP3YDL018C 678 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 MRH1YDR033W 963 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 YDR336WYDR336W 945 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 HYP2YEL034W 474 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 GAB1YLR459W 1185 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 YNL043CYNL043C 321 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 MPP6YNR024W 561 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 YOL114CYOL114C 609 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 AVT5YBL089W 1380 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 FAA2YER015W 2235 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 YDR131CYDR131C 1671 nt2.57□□□□□ -2
DDI1P40087 TCB2YNL087W 3537 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 AI3Q0060 1248 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 PFS1YHR185C 714 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 ATG34YOL083W 1239 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 YPR027CYPR027C 834 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 YNR066CYNR066C 1311 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 SOK1YDR006C 2706 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 SWC4YGR002C 1431 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 AI4Q0065 1671 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 VPS30YPL120W 1674 nt2.56□□□□□ -2
DDI1P40087 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YCL019WYCL019W 5313 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 RGR1YLR071C 3249 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 POL4YCR014C 1749 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 STN1YDR082W 1485 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YDR239CYDR239C 2364 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 TDA10YGR205W 873 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YHR180WYHR180W 492 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YIL054WYIL054W 318 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YJR056CYJR056C 711 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 VAC14YLR386W 2643 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 THI80YOR143C 960 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 SLY41YOR307C 1362 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 PBP2YBR233W 1242 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 PSY2YNL201C 2577 nt2.55□□□□□ -2
DDI1P40087 ROG1YGL144C 2058 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 ARP9YMR033W 1404 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 YNL011CYNL011C 1335 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 MSH4YFL003C 2637 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 SNU23YDL098C 585 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 PPH3YDR075W 927 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 YGL159WYGL159W 1113 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 YIP5YGL161C 933 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 RPL24BYGR148C 468 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 TCD1YHR003C 1290 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 BAT1YHR208W 1182 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 RPA12YJR063W 378 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 REC102YLR329W 795 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 ATP11YNL315C 957 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 ERV15YBR210W 429 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 PEX5YDR244W 1839 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.54□□□□□ -2
DDI1P40087 FRE8YLR047C 2061 nt2.53□□□□□ -2
DDI1P40087 FMN1YDR236C 657 nt2.53□□□□□ -2
DDI1P40087 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.53□□□□□ -2
DDI1P40087 MET14YKL001C 609 nt2.53□□□□□ -2
DDI1P40087 MPD2YOL088C 834 nt2.53□□□□□ -2
DDI1P40087 TPT1YOL102C 693 nt2.53□□□□□ -2
DDI1P40087 ICS2YBR157C 768 nt2.53□□□□□ -2
DDI1P40087 AIM4YBR194W 372 nt2.53□□□□□ -2
DDI1P40087 YKR078WYKR078W 1758 nt2.53□□□□□ -2
DDI1P40087 CDC5YMR001C 2118 nt2.53□□□□□ -2.01
DDI1P40087 TAF2YCR042C 4224 nt2.53□□□□□ -2.01
DDI1P40087 HBT1YDL223C 3141 nt2.53□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YBR259WYBR259W 2067 nt2.53□□□□□ -2.01
DDI1P40087 NMA111YNL123W 2994 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 AI2Q0055 2565 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 FIN1YDR130C 876 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 MFA1YDR461W 111 nt2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.2 ms