Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXN3O00409 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms