Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN11AQ9UI33 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms