Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP30Q70CQ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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