Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1CQ15572 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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