Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YDR444WYDR444W 2064 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 AMD1YML035C 2433 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 MNN5YJL186W 1761 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 ANR2YKL047W 1551 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 NPR2YEL062W 1848 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YDR115WYDR115W 318 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YGL052WYGL052W 306 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 TEN1YLR010C 483 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YOR331CYOR331C 558 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YPR096CYPR096C 303 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YPR098CYPR098C 486 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YEH2YLR020C 1617 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 STB5YHR178W 2232 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 ATG7YHR171W 1893 nt6.23□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 EKI1YDR147W 1605 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SSZ1YHR064C 1617 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 AHC2YCR082W 387 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 NIT2YJL126W 924 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YLL044WYLL044W 447 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YAR070CYAR070C 300 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 GEP3YOR205C 1671 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 IRS4YKR019C 1848 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 GAA1YLR088W 1845 nt6.22□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YBP1YBR216C 2025 nt6.21□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 LPP1YDR503C 825 nt6.21□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 MPC3YGR243W 441 nt6.21□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 STM1YLR150W 822 nt6.21□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 CDC42YLR229C 576 nt6.21□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 JIP3YLR331C 378 nt6.21□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt6.21□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 AIM3YBR108W 2844 nt6.21□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 PMT6YGR199W 2280 nt6.2□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 HIS7YBR248C 1659 nt6.2□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 OSW7YFR039C 1533 nt6.2□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt6.2□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YCL022CYCL022C 516 nt6.2□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 NSE5YML023C 1671 nt6.2□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 ROY1YMR258C 1662 nt6.2□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 LSG1YGL099W 1923 nt6.19□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 LDB19YOR322C 2457 nt6.19□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YBR197CYBR197C 654 nt6.19□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 PPQ1YPL179W 1650 nt6.19□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 NOC2YOR206W 2133 nt6.19□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 SKN1YGR143W 2316 nt6.19□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 HIR1YBL008W 2523 nt6.19□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 DIE2YGR227W 1578 nt6.18□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YPK2YMR104C 2034 nt6.18□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 SER33YIL074C 1410 nt6.18□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 ALE1YOR175C 1860 nt6.18□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 SHH3YMR118C 591 nt6.18□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 PTK2YJR059W 2457 nt6.18□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 RAD61YDR014W 1944 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 RSC30YHR056C 2652 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 RSC2YLR357W 2670 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 WHI3YNL197C 1986 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YDL023CYDL023C 321 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YDR526CYDR526C 471 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 PGA1YNL158W 597 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 RPC40YPR110C 1008 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 VPS33YLR396C 2076 nt6.17□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 SAS10YDL153C 1833 nt6.16□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 UBC1YDR177W 648 nt6.16□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 RPS2YGL123W 765 nt6.16□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YIR014WYIR014W 729 nt6.16□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 ATP14YLR295C 375 nt6.16□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YOR146WYOR146W 306 nt6.16□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 RMI1YPL024W 726 nt6.16□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 DPH2YKL191W 1605 nt6.16□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 BDP1YNL039W 1785 nt6.16□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 ARP5YNL059C 2268 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 YDR274CYDR274C 372 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 RSM25YIL093C 795 nt6.15□□□□□ -1.42
NCR1Q12200 SHQ1YIL104C 1524 nt6.15□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 KEL1YHR158C 3495 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 OCT1YKL134C 2319 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 ASI1YMR119W 1875 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YEL014CYEL014C 306 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 ALG13YGL047W 609 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 NOP19YGR251W 591 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 IRC18YJL037W 675 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YBR064WYBR064W 429 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 HSP26YBR072W 645 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 STR2YJR130C 1920 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 GEM1YAL048C 1989 nt6.14□□□□□ -1.43
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