Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 YBL055CYBL055C 1257 nt3.18□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 CWH41YGL027C 2502 nt3.18□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 SNT1YCR033W 3681 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 DUF1YOL087C 3351 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 SLA1YBL007C 3735 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 FRE8YLR047C 2061 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 HBT1YDL223C 3141 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 SHR3YDL212W 633 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 DYN2YDR424C 279 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 SEC4YFL005W 648 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 YKL070WYKL070W 510 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 MRPL38YKL170W 417 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 RPF2YKR081C 1035 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 COX19YLL018C-A 297 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 PRM6YML047C 1059 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 IMP1YMR150C 573 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 YOL162WYOL162W 648 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 GCY1YOR120W 939 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 APA1YCL050C 966 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 NUP60YAR002W 1620 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 EAP1YKL204W 1899 nt3.17□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 DYN1YKR054C 12279 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 ARP4YJL081C 1470 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 MED1YPR070W 1701 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 RPS14AYCR031C 414 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 YPD1YDL235C 504 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 MIX14YDR031W 366 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 COG7YGL005C 840 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 RPL30YGL030W 318 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 TMA19YKL056C 504 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 PDR17YNL264C 1053 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 MSR1YHR091C 1932 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 TRM82YDR165W 1335 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 MDM36YPR083W 1740 nt3.16□□□□□ -1.9
CIK1Q01649 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YGL242CYGL242C 546 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 AIM26YKL037W 357 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 SED5YLR026C 1023 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YNL203CYNL203C 612 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 INO4YOL108C 456 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 snR35snR35 204 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 SWD3YBR175W 948 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 MUB1YMR100W 1863 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 KAP104YBR017C 2757 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YMR046CYMR046C 1323 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.15□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 GIS4YML006C 2325 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 TOM1YDR457W 9807 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 MAK11YKL021C 1407 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 NRG1YDR043C 696 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 TVP15YDR100W 432 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 SRB7YDR308C 423 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 GUK1YDR454C 564 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 MRM2YGL136C 963 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 RPL24BYGR148C 468 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 LSM8YJR022W 330 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 MBR1YKL093W 1020 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 CMC1YKL137W 336 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YBL062WYBL062W 381 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 ARO4YBR249C 1113 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 FLO1YAR050W 4614 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 TAF2YCR042C 4224 nt3.14□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 NOP4YPL043W 2058 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 PDC2YDR081C 2778 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 RIX1YHR197W 2292 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 SKO1YNL167C 1944 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 BSC1YDL037C 987 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 RMT2YDR465C 1239 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 PEX14YGL153W 1026 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YOR366WYOR366W 354 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 STN1YDR082W 1485 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 VAC14YLR386W 2643 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YBR259WYBR259W 2067 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 TIF4631YGR162W 2859 nt3.13□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YJL049WYJL049W 1353 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YDR061WYDR061W 1620 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 ERP3YDL018C 678 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 RUB1YDR139C 234 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 RPN9YDR427W 1182 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 MAM1YER106W 909 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YHR212CYHR212C 336 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YJL114WYJL114W 681 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YAR060CYAR060C 336 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 TPM1YNL079C 600 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 AIM4YBR194W 372 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YKL100CYKL100C 1764 nt3.12□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 MAK5YBR142W 2322 nt3.11□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 CIN8YEL061C 3003 nt3.11□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 NOP56YLR197W 1515 nt3.11□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 HLR1YDR528W 1272 nt3.11□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YFL015CYFL015C 495 nt3.11□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YGR160WYGR160W 612 nt3.11□□□□□ -1.91
CIK1Q01649 YJL169WYJL169W 369 nt3.11□□□□□ -1.91
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