Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms