Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 RRM3YHR031C 2172 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 CSR2YPR030W 3366 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 NTO1YPR031W 2247 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 CIN8YEL061C 3003 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YNL011CYNL011C 1335 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 FRE8YLR047C 2061 nt3.15□□□□□ -1.9
SEC28P40509 PDC2YDR081C 2778 nt3.15□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 GIC2YDR309C 1152 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 DIG2YDR480W 972 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 PAU10YDR542W 363 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 NSA2YER126C 786 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 PAU11YGL261C 363 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 MBR1YKL093W 1020 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 PAU4YLR461W 363 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 DLT1YMR126C 1029 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 MIC27YNL100W 705 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 ATG19YOL082W 1248 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 MED1YPR070W 1701 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 PSK1YAL017W 4071 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 STE23YLR389C 3084 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 TGL3YMR313C 1929 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 CWH41YGL027C 2502 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 POL3YDL102W 3294 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC28P40509 PEX5YDR244W 1839 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YOR296WYOR296W 3870 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 DPP1YDR284C 870 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 LSM4YER112W 564 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 SUB1YMR039C 879 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 UFE1YOR075W 1041 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 HUT1YPL244C 1020 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 SWD3YBR175W 948 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 TSC11YER093C 4293 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 MAK5YBR142W 2322 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC28P40509 RIF1YBR275C 5751 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YDR491CYDR491C 492 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YEL010WYEL010W 351 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC28P40509 COX23YHR116W 456 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC28P40509 ALB1YJL122W 528 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC28P40509 MRPL38YKL170W 417 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC28P40509 RPL6BYLR448W 531 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC28P40509 snR44snR44 211 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC28P40509 BUD4YJR092W 4344 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC28P40509 FLO1YAR050W 4614 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC28P40509 MIX14YDR031W 366 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YER138W-AYER138W-A 105 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YFH7YFR007W 1062 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YNL203CYNL203C 612 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YBR300CYBR300C 498 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YKL100CYKL100C 1764 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC28P40509 TAO3YIL129C 7131 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 MET5YJR137C 4329 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 FAR1YJL157C 2493 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 DOG2YHR043C 741 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 DAL2YIR029W 1032 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 LSM8YJR022W 330 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YKL091CYKL091C 933 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 MRPS8YMR158W 468 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YNL276CYNL276C 396 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YCK2YNL154C 1641 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 VTC4YJL012C 2166 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 SKO1YNL167C 1944 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 CCT7YJL111W 1653 nt3.11□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YPD1YDL235C 504 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 PEX14YGL153W 1026 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YKL131WYKL131W 522 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 HYM1YKL189W 1200 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 PRM6YML047C 1059 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 SSU72YNL222W 621 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 VAM3YOR106W 852 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 MDM36YPR083W 1740 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 URB2YJR041C 3525 nt3.1□□□□□ -1.91
SEC28P40509 RPA190YOR341W 4995 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 PUF6YDR496C 1971 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YBR259WYBR259W 2067 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 VMA8YEL051W 771 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YGL117WYGL117W 798 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 NDL1YLR254C 570 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 VMA6YLR447C 1038 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YIP3YNL044W 531 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 PDR17YNL264C 1053 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 TYE7YOR344C 876 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 SAD1YFR005C 1347 nt3.09□□□□□ -1.91
SEC28P40509 NDT80YHR124W 1884 nt3.09□□□□□ -1.92
SEC28P40509 DSE4YNR067C 3354 nt3.09□□□□□ -1.92
SEC28P40509 MUB1YMR100W 1863 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YHR022CYHR022C 771 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YIL175WYIL175W 318 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 YKL070WYKL070W 510 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 PDS5YMR076C 3834 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 INO4YOL108C 456 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 ATP22YDR350C 2055 nt3.08□□□□□ -1.92
SEC28P40509 FRE2YKL220C 2136 nt3.08□□□□□ -1.92
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