Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ERG20YJL167W 1059 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YJL175WYJL175W 513 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ARC19YKL013C 516 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 TDA8YAL064C-A 381 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RPL19BYBL027W 570 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RCE1YMR274C 948 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YNL203CYNL203C 612 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 MCT1YOR221C 1083 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ATG29YPL166W 642 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 SUT2YPR009W 807 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ARO4YBR249C 1113 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ECM21YBL101C 3354 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RGC1YPR115W 3252 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ESC1YMR219W 4977 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 PUF6YDR496C 1971 nt2.65□□□□□ -1.98
DDI1P40087 CAF120YNL278W 3183 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RIT1YMR283C 1542 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 OPI6YDL096C 327 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 PET100YDR079W 336 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RPB9YGL070C 369 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 PRP18YGR006W 756 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 COX23YHR116W 456 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 SYS1YJL004C 612 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RPS22AYJL190C 393 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RPL15AYLR029C 615 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YOR203WYOR203W 354 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 IRC3YDR332W 2070 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 MED1YPR070W 1701 nt2.65□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RTT10YPL183C 3042 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 PRP8YHR165C 7242 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 THP2YHR167W 786 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 SAW1YAL027W 786 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 NNT1YLR285W 786 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YLR365WYLR365W 333 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YOL166CYOL166C 339 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 AFT2YPL202C 1251 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 MSB2YGR014W 3921 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 APC5YOR249C 2058 nt2.64□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YPL216WYPL216W 3309 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 ENP2YGR145W 2124 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 KAR5YMR065W 1515 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 ILS1YBL076C 3219 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RPL14BYHL001W 417 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 AGE2YIL044C 897 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YJR071WYJR071W 369 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 NDL1YLR254C 570 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 PSY3YLR376C 729 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YMR087WYMR087W 855 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YNL171CYNL171C 369 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 snR42snR42 351 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RRP7YCL031C 894 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.63□□□□□ -1.99
DDI1P40087 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 STE6YKL209C 3873 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 SEC27YGL137W 2670 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 MRPL38YKL170W 417 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 OMA1YKR087C 1038 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YPR050CYPR050C 414 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RRI1YDL216C 1323 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 PAM1YDR251W 2493 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YKL222CYKL222C 2118 nt2.62□□□□□ -1.99
DDI1P40087 EAP1YKL204W 1899 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YDR491CYDR491C 492 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 TCA17YEL048C 459 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 COBQ0105 1158 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 AST2YER101C 1293 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 PEX14YGL153W 1026 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 ATG27YJL178C 816 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 BET5YML077W 480 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 SUB1YMR039C 879 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 ECM13YBL043W 774 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 RPL20AYMR242C 519 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 IZH4YOL101C 939 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YLR001CYLR001C 2589 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 BCK1YJL095W 4437 nt2.61□□□□□ -1.99
DDI1P40087 ICR1ICR1 3199 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 CWH41YGL027C 2502 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YKL100CYKL100C 1764 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 PEF1YGR058W 1008 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 MMF1YIL051C 438 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 HOT13YKL084W 351 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 SMA2YML066C 1110 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 SWD3YBR175W 948 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 DPB3YBR278W 606 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 CTP1YBR291C 900 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 TLC1TLC1 1301 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 SRO77YBL106C 3033 nt2.6□□□□□ -1.99
DDI1P40087 SRP68YPL243W 1800 nt2.59□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YGR017WYGR017W 894 nt2.59□□□□□ -1.99
DDI1P40087 UPF3YGR072W 1164 nt2.59□□□□□ -1.99
DDI1P40087 MRPL9YGR220C 810 nt2.59□□□□□ -1.99
DDI1P40087 YLL047WYLL047W 384 nt2.59□□□□□ -1.99
DDI1P40087 INP1YMR204C 1263 nt2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.6 ms