Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms