Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms