Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3C1V9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3C1V9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3C1V9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3C1V9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3C1V9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3C1V9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3C1V9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3C1V9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3C1V9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3C1V9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3C1V9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3C1V9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3C1V9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3C1V9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3C1V9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3C1V9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3C1V9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3C1V9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.9 ms