Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 DPB3YBR278W 606 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 TOS3YGL179C 1683 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 CBF5YLR175W 1452 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 DBF4YDR052C 2115 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 SUP35YDR172W 2058 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 PDC1YLR044C 1692 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 PIN4YBL051C 2007 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 MRM2YGL136C 963 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 ECL1YGR146C 636 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YML053CYML053C 639 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 GRE2YOL151W 1029 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 LEE1YPL054W 906 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 TPK2YPL203W 1143 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 PGS1YCL004W 1566 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RRP3YHR065C 1506 nt5.32□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 ELP2YGR200C 2367 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 TPA1YER049W 1935 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YER046W-AYER046W-A 330 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 OTU1YFL044C 906 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 AFB1YLR040C 675 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 SVS1YPL163C 783 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 AFT2YPL202C 1251 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 snR41snR41 95 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 MET12YPL023C 1974 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 AVT2YEL064C 1443 nt5.31□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YMR102CYMR102C 2505 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 NUP85YJR042W 2235 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 EBS1YDR206W 2655 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 PDR5YOR153W 4536 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YGL039WYGL039W 1047 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 VMA10YHR039C-A 345 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 ACF4YJR083C 930 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YPR174CYPR174C 666 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 TGL3YMR313C 1929 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 EXO70YJL085W 1872 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 PRM15YMR278W 1869 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 SWC4YGR002C 1431 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RNT1YMR239C 1416 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RIM21YNL294C 1602 nt5.3□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 GDH2YDL215C 3279 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 GWT1YJL091C 1473 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 CGR1YGL029W 363 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 TRX2YGR209C 315 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RPI1YIL119C 1224 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 SDO1YLR022C 753 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YKE2YLR200W 345 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YLR428CYLR428C 345 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 GPI15YNL038W 690 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YNL181WYNL181W 1224 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 snR17asnR17a 333 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YOL075CYOL075C 3885 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 DAK1YML070W 1755 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 FAA1YOR317W 2103 nt5.29□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RIM15YFL033C 5313 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 THI13YDL244W 1023 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YDR115WYDR115W 318 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YDR262WYDR262W 819 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YGL088WYGL088W 366 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RRF1YHR038W 693 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 VPH2YKL119C 648 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RPL6BYLR448W 531 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 ALG14YBR070C 714 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 APC5YOR249C 2058 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 FAR8YMR029C 1572 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RTC1YOL138C 4026 nt5.28□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 VIP1YLR410W 3441 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 SPI1YER150W 447 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 VPS45YGL095C 1734 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 IES3YLR052W 753 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 YNL058CYNL058C 951 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 CAT5YOR125C 702 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 CHL1YPL008W 2586 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 AZR1YGR224W 1842 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 PEP7YDR323C 1548 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 DPH6YLR143W 2058 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 PEX6YNL329C 3093 nt5.27□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 SIP5YMR140W 1470 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 YEL077CYEL077C 3834 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 GDE1YPL110C 3672 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 BUD22YMR014W 1560 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 MGT1YDL200C 567 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 CPR5YDR304C 678 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 PAM18YLR008C 507 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 SWC7YLR385C 399 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 RIM9YMR063W 720 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 ERG2YMR202W 669 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 MRPS9YBR146W 837 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 AVT5YBL089W 1380 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 SSH4YKL124W 1740 nt5.26□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 GMC1YDR506C 1827 nt5.25□□□□□ -1.57
SUB2Q07478 IRC3YDR332W 2070 nt5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.1 ms