Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms