Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP19O94966 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP19O94966 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP19O94966 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP19O94966 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP19O94966 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP19O94966 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP19O94966 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP19O94966 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP19O94966 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP19O94966 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP19O94966 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP19O94966 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP19O94966 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP19O94966 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP19O94966 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP19O94966 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP19O94966 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP19O94966 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP19O94966 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP19O94966 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP19O94966 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP19O94966 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP19O94966 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP19O94966 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP19O94966 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP19O94966 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP19O94966 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP19O94966 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP19O94966 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP19O94966 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP19O94966 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP19O94966 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP19O94966 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP19O94966 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP19O94966 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP19O94966 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP19O94966 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms