Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC47Q96A33 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms