Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNE4Q8N205 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYNE4Q8N205 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms